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[IV3D-USERS] Re: Loading Label volumes


Chronological Thread 
  • From: tom fogal <tfogal@sci.utah.edu>
  • To: James J Cook <james.j.cook@duke.edu>
  • Cc: iv3d-users@sci.utah.edu
  • Subject: [IV3D-USERS] Re: Loading Label volumes
  • Date: Fri, 13 May 2011 14:25:48 -0600

Hi,

James J Cook <james.j.cook@duke.edu> writes:
>   I am loading a 3d analyze format image volume of labels.
>  I have 37 descrete levels.
>  When i load this data imagevis seems to add other levels to the     
> dataset between my labeled regions.                                  
> Is there any way to stop this? 

Is this version 2.0.0 or are you building from svn by any chance?
This juuust just changed.  Also, what type are your data (floating
point?)? [1]

Some things of note, regardless of version:

  . if your data are > 16bit, they are quantized to 16bit

  . for large data, we produce a multiresolution hierarchy via a
  downsampling approach which includes averaging.  The averaging can of
  course 'smear' out your flags, especially if they are close together

  . the (visible) histogram behind the transfer functions is computed
  on the lowest resolution data, for performance reasons, but we're
  still doing the correct thing with the higher resolution data,
  despite appearances.

  . We utilize trilinear interpolation during rendering.  This is just
  plain wrong for flag data...

We've heard complaints about that last one before... should really be
fixed.  Gimme a min..

HTH,

-tom

[1] If you have no idea, you can open up ImageVis3D's debug window
(under "Help"), check the 'message' channel, and then try to convert
your dataset.  There will be a message "n-bit XxYxZ data", and then the
message after that will describe the data type.



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