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[IV3D-USERS] Re: Loading Label volumes


Chronological Thread 
  • From: tom fogal <tfogal@sci.utah.edu>
  • To: James J Cook <james.j.cook@duke.edu>
  • Cc: iv3d-users@sci.utah.edu
  • Subject: [IV3D-USERS] Re: Loading Label volumes
  • Date: Fri, 13 May 2011 14:55:28 -0600

James J Cook <james.j.cook@duke.edu> writes:
[snip]
> Can i turn off that trilinear interpolation for rendering? That      
> might be just what i want to do.                                     

Yep, the part I've snipped guarantees that this is the issue.

> If i build from svn will this option be available?

You can't disable it (in any version) yet, but I'm working on it.
I need to release 2.0.1 first, though.  Nearest neighbor (i.e.
uninterpolated) will make it into 2.1.0.  I'll send you a private mail
when it's available in svn / the devbuilds.

Cheers,

-tom

> tom fogal <tfogal@sci.utah.edu> 
> 05/13/11 04:25 PM
> 
> To
> James J Cook <james.j.cook@duke.edu>
> cc
> iv3d-users@sci.utah.edu
> Subject
> Re: [IV3D-USERS] Loading Label volumes
> 
> 
> Hi,
> 
> James J Cook <james.j.cook@duke.edu> writes:
> >   I am loading a 3d analyze format image volume of labels.
> >  I have 37 descrete levels.
> >  When i load this data imagevis seems to add other levels to the 
> > dataset between my labeled regions. 
> > Is there any way to stop this? 
> 
> Is this version 2.0.0 or are you building from svn by any chance?
> This juuust just changed.  Also, what type are your data (floating
> point?)? [1]
> 
> Some things of note, regardless of version:
> 
>   . if your data are > 16bit, they are quantized to 16bit
> 
>   . for large data, we produce a multiresolution hierarchy via a
>   downsampling approach which includes averaging.  The averaging can of
>   course 'smear' out your flags, especially if they are close together
> 
>   . the (visible) histogram behind the transfer functions is computed
>   on the lowest resolution data, for performance reasons, but we're
>   still doing the correct thing with the higher resolution data,
>   despite appearances.
> 
>   . We utilize trilinear interpolation during rendering.  This is just
>   plain wrong for flag data...
> 
> We've heard complaints about that last one before... should really be
> fixed.  Gimme a min..
> 
> HTH,
> 
> -tom
> 
> [1] If you have no idea, you can open up ImageVis3D's debug window
> (under "Help"), check the 'message' channel, and then try to convert
> your dataset.  There will be a message "n-bit XxYxZ data", and then the
> message after that will describe the data type.



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