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Re: [SCIRUN-USERS] Execution error


Chronological Thread 
  • From: "S Ng" <dark_avenger7@lycos.com>
  • To: "David Weinstein" <dmw@sci.utah.edu>
  • Cc: scirun-users@sci.utah.edu
  • Subject: Re: [SCIRUN-USERS] Execution error
  • Date: Tue, 06 Apr 2004 13:32:14 -0400
  • Organization: Lycos Mail (http://www.mail.lycos.com:80)

Hi Dave,

Tried your suggestion. Doesn't work either.

Shaun.
--

--------- Original Message ---------

DATE: Tue, 6 Apr 2004 10:46:09 
From: David Weinstein <dmw@sci.utah.edu>
To: dark_avenger7@lycos.com
Cc: scirun-users@sci.utah.edu

>Hi,
>
>I think I've seen this same error before when SCIRun was loading in the  
>wrong Tcl library at run-time (because I had my LD_LIBRARY_PATH  
>environment variable set).  Please make sure you have unset your  
>LD_LIBRARY_PATH before running SCIRun.
>
>Cheers,
>Dave
>
>
>On Apr 6, 2004, at 9:14 AM, S Ng wrote:
>
>> Hi!
>>
>> I've just downloaded the source tar ball of SCIRun/Insight package.  
>> I've configured using the following options:
>>
>> ../src/configure  
>> --with-thirdparty=/usr/local/SCIRun/Thirdparty/1.29/Linux/gcc-3.2.2 
>> -32bit
>>
>> then did a "make". The compilation process completed without any  
>> errors (couple of warnings though) but after setting the 3 environment  
>> variables, I tried to execute scirun, but got the following error.  
>> (The SCIRun binary is installed at /home/test/SCI-run/SCIRun/linux.)
>>
>> SCIRun/linux> ./scirun
>> Initializing the tcl packages: tcl, tk, itcl, itk, Thread "TCL main  
>> event loop"(pid 10184) caught signal SIGILL at address (nil) (illegal  
>> ins
>> truction)
>> Backtrace:
>> /home/test/SCI-run/SCIRun/linux/lib/ 
>> libCore_Thread.so(_ZN6SCIRun6Thread9niceAbortEv+0x18) [0x4009e978]
>> /home/test/SCI-run/SCIRun/linux/lib/libCore_Thread.so [0x400a45db]
>> /lib/i686/libpthread.so.0 [0x408cca6a]
>> /lib/i686/libc.so.6 [0x40548dc8]
>> /usr/local/SCIRun/Thirdparty/1.20/Linux/gcc-3.2.2-32bit/lib/ 
>> libBLT24.so(Blt_Init+0x1e) [0x408f6a5e]
>> /home/test/SCI-run/SCIRun/linux/lib/ 
>> libCore_TkExtensions.so(Tcl_AppInit+0x102) [0x400e30f2]
>> /usr/local/SCIRun/Thirdparty/1.20/Linux/gcc-3.2.2-32bit/lib/ 
>> libtk.so(Tk_MainEx+0x21f) [0x403a4bb7]
>> /home/test/SCI-run/SCIRun/linux/lib/ 
>> libCore_TkExtensions.so(tkMain+0x2e) [0x400e2fde]
>> /home/test/SCI-run/SCIRun/linux/lib/ 
>> libCore_GuiInterface.so(_ZN6SCIRun7TCLTask3runEv+0x20) [0x4008bb40]
>> /home/test/SCI-run/SCIRun/linux/lib/ 
>> libCore_Thread.so(_ZN6SCIRun6Thread8run_bodyEv+0x12) [0x4009e352]
>> /home/test/SCI-run/SCIRun/linux/lib/libCore_Thread.so [0x400a3433]
>> /lib/i686/libpthread.so.0 [0x408ca020]
>> /lib/i686/libc.so.6(__clone+0x3a) [0x405eaeca]
>>  1024: main (state=blocking on semaphore, TCLTask startup semaphore)
>>  1026: TCL main event loop (detached, state=running)
>>
>> Abort signalled by pid: 10184
>> Occured for thread: "TCL main event loop"
>> resume(r)/dbx(d)/cvd(c)/kill thread(k)/exit(e)?
>>
>> Thanks.
>>
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>> ==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib        ;
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