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./scirun -e <path to .net file>

will execute a network within scirun from the command line.  It will not
exit until you either kill it externally or select exit from the file
menu.

./scirun -regression <path to .net file>

will execute and exit if you have a viewer window open in your .net. It
will dump an image of what was in the viewer window after execution,
then exit. If you dont have a viewer I think it will exit after 3
mins...

--mc


On Wed, 2005-04-20 at 20:21, lgraham@postoffice.utas.edu.au wrote:
> G'day,
> 
> I am using a program that can estimate the parameters values in a model.  
> It does this by running the model, and then compares the experimental
> measured data with the model output data. It then adjusts the model
> parameters values to minimise the difference between the two sets of
> data. It repeats this process over and over until there is little
> difference between the measured data and the simulated data.
> 
> I have created a network in SCIRun to setup a mesh, assign parameters,
> setup a finite element matrix, and then solve it.
> I was thinking of running the parameter estimation program within SCIRun
> by created a module that runs it,  e.g. system(/home/lgraham/paramest/).
> When preparing the parameter estimation program, it requires the
> executable file name (or command  line) of the model to run it, which is
> defined in its setup file.
> I was thinking of some how executing the network by a command line, so
> that the parameter estimation program can run it.
> 
> Does anyone know how to do this? Or know of a more better way?
> 
> 
> 
> Leon 
> 
> 
> ===========================================================================
> == The SCIRun Users mailing list: send email to majordomo@sci.utah.edu   ==
> == for more details.                                                     ==
> == Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:          ==
> ==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib         ==
> ===========================================================================

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== The SCIRun Users mailing list: send email to majordomo@sci.utah.edu   ==
== for more details.                                                     ==
== Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:          ==
==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib         ==
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• [SCIRUN-USERS] executing a network by an external program, lgraham, 04/20/2005
  • Re: [SCIRUN-USERS] executing a network by an external program, Martin Cole, 04/21/2005
  • Re: [SCIRUN-USERS] executing a network by an external program, David Weinstein, 04/21/2005
  • Re: [SCIRUN-USERS] executing a network by an external program, Michael Callahan, 04/21/2005

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