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Re: [SCIRUN-USERS] utah torso document


Chronological Thread 
  • From: Hongyu Sun <sun.hongyu@gmail.com>
  • To: Erik Jorgensen <erikj@sci.utah.edu>
  • Cc: "dataset-users@sci.utah.edu" <scirun-users@sci.utah.edu>
  • Subject: Re: [SCIRUN-USERS] utah torso document
  • Date: Thu, 25 Aug 2005 16:40:23 -0500
  • Domainkey-signature: a=rsa-sha1; q=dns; c=nofws; s=beta; d=gmail.com; h=received:message-id:date:from:to:subject:cc:in-reply-to:mime-version:content-type:content-transfer-encoding:content-disposition:references; b=SUS57Rlc9A5Hd1iQ2h5OErA+0esIFyoP46PfZWhWnoX1VZvJq+5YiAMTgFZS4R/0kSHSsu0f19Po/80SK7pZLLKPPnQgMZZet512dbyx21PEfjKrZWXc+2caoodNcK+tGZsdNYxaSfIB4anAFHz51q0OMAL3eyEZlSqHqQHDU6o=
On 8/23/05, Erik Jorgensen <erikj@sci.utah.edu> wrote:
> Hongyu,
> 
> Here is some info for the Utah Torso model. I have added it to the
> dataset in the archive. Let me know if you need more info.
> 
> Thanks.
> 
> Erik Jorgensen
> SCI Media
> -------
> 
> Description:
> 
> High resolution geometry of the Utah Torso model. The meshes are
> tetrahedral volumes, with conductivity tensors stored with the elements.
> There are five different conductivity values throughout the volume. The
> surfaces are TriSurfs and correspond to the boundaries of the distinct
> conductivity regions. For the meshes labeled {01,02,05,10,25,50}, those
> numbers correspond to the percent of nodes from the full mesh that are
> in those lower-resolution meshes.
> 
> Conductivities:
>    0 / air          / 0.0
>    1 / skin         / 0.00005
>    2 / fat          / 0.0000375
>    3 / muscle       / 0.000125
>    4 / lung         / 0.000054
>    5 / heartmuscle  / 0.000238
>    6 / heartchamber / 0.00068
>    7 / fatpad       / 0.00005
>    8 / vessel       / 0.00068
>    9 / rib          / 0.00000625
> Number of nodes:  168930 (low-res =  8278)
> Number of cells: 1082723 (low-res = 51419)
> Bounding box: [-273.95, -124.18, 15] -- [269.41, 115.44, 575]
> 
> Hongyu Sun wrote:
> > Hi, where I can find the utah torso text documentation?
> >
> >
> > http://software.sci.utah.edu/cgi-bin/NCRRdatasets.pl?id=utahtorso-text
> >
> >
> > Thanks !
> >
> >
> > HS
> >
> > ===========================================================================
> > == The SCIRun Users mailing list: send email to majordomo@sci.utah.edu   
> > ==
> > == for more details.                                                     
> > ==
> > == Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:          
> > ==
> > ==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib         ;
> > ==
> > ===========================================================================
> 
Hi, Erik:

Thank you. One thing I got a bit confused is that "five different
conductivity values", while the listed conductivity values has about
10 values.
 
Also I found the text format of the data is ready. But I am not quite
sure about the format of the .fac, .pts files for tissues? What do
they mean? For example, utahtorso-fat.ts.pts and utahtorso-fat.ts.fac?
Since all the meshes' geometry and conductivity are given, what is the
use of the tissue information?

Many thanks,

HS

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== The SCIRun Users mailing list: send email to majordomo@sci.utah.edu   ==
== for more details.                                                     ==
== Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:          ==
==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib         ==
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