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Re: [**SPAM**][SCIRUN-USERS] is SCIRun suited for me ?

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  • From: Dana Brooks <>
  • To:
  • Cc: scirun-users <>
  • Subject: Re: [**SPAM**][SCIRUN-USERS] is SCIRun suited for me ?
  • Date: Fri, 03 Mar 2006 08:26:37 -0500

Shi Jin, hi,

As far as I know there is nothing now implemented in SCIRun to model the
diffusion equation directly. You might be able to use either the finite
element or boundary element modules to build such a model, but I have
not thought carefully about it and I have some doubts it would be a
trivial task --- that is, I think it would probably require more than
just connecting existing modules together. On the other hand, if you
have other code, or can get other code, to do the basic modeling (for
instance, the EIDOR project, written in Matlab, might be useful), then
you might be able to connect to it through SCIRun's interface mechanisms
such as the MatlabInterface module. We have used a similar approach with
EIDOR to use its finite element solution for EIT with advanced electrode
boundary conditions.

We do have collaborators interested in modeling diffusion of light in
tissue with SCIRun and I think we will add this capability, but it may
not be for quite some time ...

I hope this response is useful ...

best regards,

Dana Brooks

Dana H. Brooks
Associate Professor, ECE Dept
Associate Director, Communications and Digital Signal Processing
Research Center
PI, BioMedical Imaging and Signal Processing Lab
Northeastern University
Boston, MA USA

shi jin wrote:

>Dear Professor!
>       Thank you for your kindness for SCIRun. I have downloaded SCIRun. My 
> research is focused on Bioluminenst Tomography based on diffusion Equation. 
> I want to konw if it is easy to modify the equation in SCIRun and if SCIRun 
> is suited for Bioluminenst Tomography.
>       Thank you very much and eager to your reply!
>             shi jin
>          2006-03-03
>== The SCIRun Users mailing list: send email to   ==
>== for more details.                                                     ==
>== Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:          ==
>==   see         ==

== The SCIRun Users mailing list: send email to   ==
== for more details.                                                     ==
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