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Re: [SCIRUN-USERS] Sequential data in SCIRun


Chronological Thread 
  • From: Michael Callahan <callahan@sci.utah.edu>
  • To: Brock Tice <brock.tice@runbox.com>
  • Cc: scirun-users@sci.utah.edu
  • Subject: Re: [SCIRUN-USERS] Sequential data in SCIRun
  • Date: Wed, 05 Apr 2006 14:44:10 -0600

There are several ways to handle data sequences.  The most convenient is
to turn it into a large sequence of data and use MatrixSelectVector or
NrrdSelectTime to walk through time slices and operate on them.  The
specifics of what you wanted to look at would depend upon your data
sets, but for instance you could run through computations on a beating
heart (model deformations with ManageFieldMesh), or voltage data on a
static model (EEG data on a head model, using ManageFieldData to stick
the data onto your model), or play a sequence of volume data captures
(MRI of someone breathing with a cancerous mass at the back of their
lungs, just pull the sequence of volumes out and visualize them
efficiently).

  Michael

On Wed, 2006-04-05 at 12:10 -0500, Brock Tice wrote:
> Hi All,
>    I decided to have a fresh look at SCIRun after a few years, and  
> everything was looking good, until I realized a major shortcoming --  
> I can't seem to find any way to load (and play) sequential scalar  
> data.  map3d seems to do this but lacks many of the powerful features  
> of SCIRun. Is there a way to do this without writing a new module?
> 
> Thanks,
> -----------------------------------------------------
> Brock M. Tice
> 
> blog - http://virtuallyshocking.com
> contact info - http://brocktice.com
> 
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> == The SCIRun Users mailing list: send email to majordomo@sci.utah.edu   ==
> == for more details.                                                     ==
> == Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:          ==
> ==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib         ==
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