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Hello,
 
We are doing something similar with cardiac tissues and use both Dirichlet 
and Neuman boundary conditions to solve FEM's of the torso.  
 
http://www.sci.utah.edu/ncrr/wiki/index.php/CIBC:Collab:Triedman  ;(Need to 
update this
 
 
SCIRun does this very well, and this part of the code is being improved with 
alot of options for local remeshing (increased density) around electrodes. 
The modules required  are in the "ModelCreation" portion which is a package 
which must be set like "MATLAB and BIOPSE" as an option when building in 
cmake/ccmake.  As things evolve we hope to make this easier to use and have 
some "standarized" nets where you can import segmented images, place 
electrodes, solve, and visualize.  We are pretty much doing that now, but 
things are a bit fragile.
 
Jeroen Stinstra is the master of this portion of things.
 
mj
 
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Matthew Jolley, MD
Children's Hospital Boston
Matthew.Jolley@cardio.chboston.org 
<mailto:Matthew.Jolley@cardio.chboston.org> 
Pager 6132

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From: owner-scirun-users@sci.utah.edu on behalf of Salinas, Felipe Santiago
Sent: Mon 4/30/2007 12:00
To: scirun-users@sci.utah.edu
Subject: [SCIRUN-USERS] BioPSE: dipole inputs & FEM boundary conditions



Hello,


As are most new users of SCIrun I am am very imrpessed with the documentation 
that is available for the various modules and packages. However, I have some 
very basic questions which may/may not have involved solutions. Currently I 
am modeling the induced E-field of externally applied magnetic fields (in 
brain tissues). My three questions are:

Can SCIrun/BioPSE simulate the induced E-field when given a set of electric 
dipoles (i.e. from vector potentials mapping current in a coil)?

Does the dipole (widget) in Chapter 3 of the BioPSE tutorial have to be a 
magnetic dipole?

Finally, for BioPSE's FEM modules, are there any specific applications with 
Neumann boundary conditions? I remember seeing somewhere that the Dirichlet 
B.C.'s are used but Neumann B.C.'s are assumed at the first interface.


Any help regarding these matters will be greatly appreciated. Thanks in 
advance!


Felipe S. Salinas
Ph.D. Candidate
Biomedical Engineering
UTHSCSA/UTSA





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• [SCIRUN-USERS] BioPSE: dipole inputs & FEM boundary conditions, Salinas, Felipe Santiago, 04/30/2007
  • RE: [SCIRUN-USERS] BioPSE: dipole inputs & FEM boundary conditions, Jolley, Matthew, 04/30/2007

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