Text archives Help

---

I've been fiddling with BioMesh3D in an attempt to create a
four-material mesh from a 1416x2544x33 (114 megabyte) volume.

I eventually got to stage 7, but ran out of memory [1].  This was on
cibc1, which apparently has 96Gb of memory and another 20 gig of swap,
so I can't just `run on a larger machine'.  What can I do to reduce
memory consumption at this stage?

-tom

[1]
  ...
  Statistics:

    Input points: 66637600

    Mesh points: 66637520 
    Mesh tetrahedra: 425832517
    Convex hull triangles: 11550

  /scratch/FEMesher_current/bin/removetetsall junctions/particle-union.1 
medial_axis_param_file.txt junctions/particle-union.m 0
  ScalarField read file: air.tight.nrrd
  Reading in the .nrrd data file ...
  scale: 1 1 1
  dims: 1424 2552 41
                DONE
  ScalarField read file: cartilage.tight.nrrd
  Reading in the .nrrd data file ...
  scale: 1 1 1
  dims: 1424 2552 41
                DONE
  ScalarField read file: muscle.tight.nrrd
  Reading in the .nrrd data file ...
  scale: 1 1 1
  dims: 1424 2552 41
                DONE
  ScalarField read file: connective.tight.nrrd
  Reading in the .nrrd data file ...
  scale: 1 1 1
  dims: 1424 2552 41
                DONE
  Reading in the vertices...
  Reading in the tets...
  PROBLEM: more then one INSIDE material!
  Creating the faces...
  terminate called after throwing an instance of 'std::bad_alloc'
    what():  std::bad_alloc

  real    14926m27.450s
  user    14846m3.406s
  sys     74m35.777s

---

• [SCIRUN-USERS] Out of memory at stage 7, tom fogal, 11/29/2010

---

Archive powered by MHonArc 2.6.16.