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[SCIRUN-USERS] Re: Building SCIRun on Ubuntu 10.04 with Mesquite [@WA]

Chronological Thread 
  • From: Ayla Khan <>
  • To:, Brock Tice <>
  • Subject: [SCIRUN-USERS] Re: Building SCIRun on Ubuntu 10.04 with Mesquite [@WA]
  • Date: Wed, 23 Nov 2011 14:00:31 -0700

Hi Brock,

Not sure why the instructions direct you to build Mesquite - you don't need 
the modules that interface to Mesquite (the last version I built with SCIRun 
was 1.1.7. You will be able to build all the networks in the tutorial if you 
enable Tetgen support - the script packaged with the source 
downloads will enable that setting and run the build for you.

I'll correct the SCIRun configuration instructions in the tutorial document.


On Nov 23, 2011, at 11:49 AM, Brock Tice wrote:

> Hi All,
>  I am attempting to follow the scirun ischemia model tutorial, but am
> having trouble compiling 4.5_2 with mesquite. I have compiled and
> installed mesquite without issue, but I'm having issues adding support
> to scirun. I'm familiar with cmake, and got all of the appropriate
> includes and libraries installed, but when I build, I eventually end up
> with this:
> --snip--
> /home/brock/local/src/SCIRun/4.5_2/src/Dataflow/Modules/Fields/
> error: no matching function for call to
> ‘Mesquite2::LaplacianSmoother::LaplacianSmoother(Mesquite2::MsqError&)’
> /home/brock/local/include/LaplacianSmoother.hpp:56: note: candidates
> are:
> Mesquite2::LaplacianSmoother::LaplacianSmoother(Mesquite2::ObjectiveFunction*)
> /home/brock/local/include/LaplacianSmoother.hpp:51: note:
>  Mesquite2::LaplacianSmoother::LaplacianSmoother(const
> Mesquite2::LaplacianSmoother&)
> /home/brock/local/src/SCIRun/4.5_2/src/Dataflow/Modules/Fields/
> error: ‘class Mesquite2::TerminationCriterion’ has no member named
> ‘add_criterion_type_with_int’
> /home/brock/local/src/SCIRun/4.5_2/src/Dataflow/Modules/Fields/
> error: ‘NUMBER_OF_ITERATES’ is not a member of
> ‘Mesquite2::TerminationCriterion’
> /home/brock/local/src/SCIRun/4.5_2/src/Dataflow/Modules/Fields/
> error: cannot declare variable ‘entity_mesh’ to be of abstract type
> ‘SCIRun::MesquiteMesh’
> /home/brock/local/src/SCIRun/4.5_2/src/Dataflow/Modules/Fields/MesquiteMesh.h:42:
> note:   because the following virtual functions are pure within
> ‘SCIRun::MesquiteMesh’:
> --snip--
> Any ideas about what I might be doing wrong? Do I need a specific
> version of Mesquite? Should I try SVN?
> Thanks,
>  --Brock
> -- 
> Brock M. Tice, Ph.D.
> VP of Operations, CardioSolv, LLC
> I will reply to your email
> within one business day.
> If you need to talk with me in real time,
> call or SMS +1-651-967-7961
> E:
> P/F: +1 (888) 525-2232 x1
> If you have questions about the 'PGP' stuff in my message, please see
> It is there so that you can verify that I am
> really the person emailing you. This is not possible with plain email.

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