Text archives Help

---

Hi Hui, Tom,

actually, the cluster version of ImageVis3D can do tiled rendering on 
multiple computers as well as stereo rendering with more than one system, 
however, this is currently work in progress. I would estimate it should be in 
some state to send it to others in about a month.

Cheers
   Jens

Am 07.02.2012 um 10:52 schrieb tom fogal:

> Hi,
> 
> let's keep the list CC'd.
> 
> I don't think I saved the transfer function... but I made it beautiful via 
> trial and error ;).  I do this kind of thing a lot, it comes easy with some 
> practice, trust me.
> 
> In the 1D transfer function you're looking at a histogram of your data set. 
>  The X axis is the data value, and the Y value is the number of times it 
> occurs in the data set.
> 
> 2D is a bit different.  The X axis is the same, but the Y axis is the 
> *gradient* (magnitude) of the data.  Large gradient magnitudes are commonly 
> observed at boundaries.  You can zoom in the 2D transfer function, just use 
> your mousewheel.
> 
> Sorry, I can't spend time investigating every data set that people send me. 
>  We can talk off-list and see if there's something worth collaborating on, 
> though.
> 
> IV3D's stereo should work fine for your wall, assuming you drive it with a 
> single computer.  Once you go beyond a single machine, you need something 
> which will coordinate rendering... IV3D can't do that on it's own.  You 
> might investigate something like Chromium or IceT.  We have some research 
> code here which can drive a wall in 2D, but nothing (yet) for 3D; ping me 
> privately if you're interested.
> 
> -tom
> 
> On 02/07/2012 12:23 AM, Yang, Hui wrote:
>> Hi Tom,
>> 
>> Thanks for adding the ".am" support for us. The example you attached
>> is very impressive. How did you get it so beautiful? Would you please
>> show me the transfer function?
>> 
>> About the transfer function, what is the meaning of the X axis and Y
>> axis in 1D/2D transfer function? When I open my laplacian data, all the
>> data are all located at lower right corner (2D transfer function). Is
>> there a way I can magnify that area so that I could choose different
>> part of the data? I've attached one small laplacian data file. Would you
>> please take a look for me?
>> 
>> We are trying to find a 3D visualization software to be installed on
>> our Hyperwall to visualize our electron density data in 3D. Does
>> imageVis3D support quad buffered stereo? We use quadro FX 4800 graphic 
>> card.
>> 
>> I really appreciate your help!
> >
>> Sincerely,
>> -Hui
>> ________________________________________
>> From: tom fogal [tfogal@sci.utah.edu]
>> Sent: Wednesday, January 04, 2012 10:05 PM
>> To: Yang, Hui
>> Subject: Re: imagevis3D data format
>> 
>> Hi Hui,
>> 
>> As you might have guessed, this slipped off my radar.  Sorry about that!
>>   You've got exactly the correct approach, though -- just send me a ping
>> when I forget about something I've promised.
>> 
>> I just committed a reader for the ".am" variant.  It won't be too hard
>> to add support for the .grd variant, but I want to get back to some
>> other work.  Let me know if that's a big holdup for you.
>> 
>> You can download a binary with support for the format from:
>> 
>>     http://www.sci.utah.edu/devbuilds/imagevis3d/
>> 
>> those binaries should be updated by midnight.  Really just look at the
>> timestamp: anything dated after this email will have support for the 
>> format.
>> 
>> Let me know if you encounter any issues,
>> 
>> -tom
>> 
>> On 01/04/2012 01:44 PM, Yang, Hui wrote:
>>> Hi Tom,
>>> 
>>> Happy New Year!
>>> 
>>> Did you get a chance to take a look at the data that I submitted? I am 
>>> still struggling to use ImageVis3D to do the volume rendering of our 
>>> data. Any help will be appreciated!
>>> 
>>> Regards,
>>> -Hui
>>> 
>>> ******************************
>>> Dr. Hui Yang
>>> Post-Doc Research Fellow
>>> Department of Chemistry
>>> Middle Tennessee State University
>>> ******************************
>>> 
>>> -----Original Message-----
>>> From: Yang, Hui
>>> Sent: Wednesday, December 14, 2011 1:57 PM
>>> To: 'tom fogal'
>>> Subject: RE: imagevis3D data format
>>> 
>>> Hi Tom,
>>> 
>>> I have tried to convert those amira files to nrrd file format by just 
>>> replacing the header. It seems to work.  But I am still far away from the 
>>> example of the volume rendering of B12 molecule (please see the attached 
>>> pdf file), which is the work from our group (by Prof. Preston MacDougall 
>>> and Christopher Henze) almost ten years ago.  That figure was obtained 
>>> using a 1D transfer function.  My question is how can I get the similar 
>>> (better) figures using the 2D transfer function.  Any help will be 
>>> appreciated!
>>> 
>>> Sincerely,
>>> -Hui
>>> 
>>> ******************************
>>> Dr. Hui Yang
>>> Post-Doc Research Fellow
>>> Department of Chemistry
>>> Middle Tennessee State University
>>> ******************************
>>> 
>>> -----Original Message-----
>>> From: Yang, Hui
>>> Sent: Wednesday, December 07, 2011 5:15 PM
>>> To: 'tom fogal'
>>> Subject: RE: imagevis3D data format
>>> 
>>> I've uploaded grd and am files of 5 different molecules to "Amira-hui".  
>>> The only difference between the grd file and am file is the header.
>>> 
>>> Thanks,
>>> -Hui
>>> 
>>> -----Original Message-----
>>> From: tom fogal [mailto:tfogal@sci.utah.edu]
>>> Sent: Wednesday, December 07, 2011 4:48 PM
>>> To: Yang, Hui
>>> Subject: Re: imagevis3D data format
>>> 
>>> You just need to use an ftp client to connect to:
>>> 
>>>      ftp.sci.utah.edu
>>> 
>>> After connecting, change into the "upload" directory.  You can then place 
>>> any AmiraMesh files you've created there.  Feel free to create a 
>>> directory to house them all, but it's not required.
>>> 
>>> When they've finished uploading, please send me a ping and let me know 
>>> what the files are called.
>>> 
>>> Cheers,
>>> 
>>> -tom
>>> 
>>> On 12/07/2011 03:44 PM, Yang, Hui wrote:
>>>> Please let me know how to set up the ftp connection.
>>>> 
>>>> Regards,
>>>> -Hui
> 

---

• [IV3D-USERS] Re: imagevis3D data format, tom fogal, 02/07/2012
  • [IV3D-USERS] Re: Re: imagevis3D data format, Jens Krüger, 02/07/2012

---

Archive powered by MHonArc 2.6.16.