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Hi Michael - I appreciate your help.

At 12:53 17/09/04 -0600, Michael Callahan <callahan@sci.utah.edu> wrote:
>There is no simple wrapper to do this at the moment.  In order to make
>it work you would have to write some SCIRun code for the modules. 
>Basically you will need to convert the data from whichever SCIRun format
>is used into which format you are using, then call your functions, then
>convert back.  If you want to wrap your executables you could do that by
>dumping the SCIRun data out to a temporary file, then invoking
>sci_system to run your executable, then reading the data back in.

Even though there would be a performance hit, that sounds like a very
reasonable first step. Is sci_system part of a module? I couldn't find
it in any of the online documentation.

>What data format are your standalone executables needing?  We may
>already have the converters in which case the wrappers would not be
>terribly difficult to write.

Just numeric ascii data in columns, separated by spaces.

I should say that my main interest, at the moment, is using SCIRun to
provide a nice graphical front-end for the existing C program 'modules'
as an alternative to cobbling together shell scripts for novice users.

Francis

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== The SCIRun Users mailing list: send email to majordomo@sci.utah.edu   ==
== for more details.                                                     ==
== Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:          ==
==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib         ==
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• [SCIRUN-USERS] Command line tools as modules?, Francis Burton, 09/17/2004
  • Re: [SCIRUN-USERS] Command line tools as modules?, Michael Callahan, 09/17/2004
  • <Possible follow-up(s)>
  • Re: [SCIRUN-USERS] Command line tools as modules?, Francis Burton, 09/18/2004
    • Re: [SCIRUN-USERS] Command line tools as modules?, Michael Callahan, 09/18/2004

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