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Re: [SCIRUN-USERS] Crash using Field Info


Chronological Thread 
  • From: Michael Callahan <callahan@sci.utah.edu>
  • To: Grégoire Walckiers <gregoire.walckiers@epfl.ch>
  • Cc: scirun-users@sci.utah.edu
  • Subject: Re: [SCIRUN-USERS] Crash using Field Info
  • Date: Wed, 31 Aug 2005 13:14:59 -0600

I have been unable to reproduce this crash here.  Do you happen to know
what version of SCIRun you are working with there?

  Michael

On Wed, 2005-08-31 at 18:11 +0200, Grégoire Walckiers wrote:
> Hi,
> 
> SCIRun crashes very often on my computer while I use FieldInfo.
> For example while using FieldInfo after a SampleStructHex (and nothing 
> else) , I've the following error:
> 
> Thread "FieldInfo"(pid 3638) caught signal SIGSEGV at address (nil) 
> (segmentation violation)
> Backtrace:
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libCore_Thread.so(_ZN6SCIRun6Thread9niceAbortEv+0x18)
>  
> [0xadd738]
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libCore_Thread.so [0xae21fe]
> /lib/tls/libc.so.6 [0x60ca48]
> /usr/lib/libstdc++.so.5(_ZNSolsEl+0x201) [0x559981]
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libCore_Datatypes.so(_ZN6SCIRunlsERSoRKNS_17LatVolMeshLatSizeE+0xa2)
>  
> [0x6de22ba ]
> /home/gwalckiers/SCIRun/on-the-fly-libs/Linux/FieldInfoAlgoCountT.StructHexVolMesh.so(_ZN6SCIRun19FieldIn
>  
> foAlgoCountTINS_16StructHexVolMeshEE12execute_nodeENS_13LockingHandleINS_4MeshEEE+0x69)
>  
> [0x486d85]
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so(_ZN6SCIRun9FieldInfo23update_input_attributesENS_
>  
> 13LockingHandleINS_5FieldEEE+0x765) [0x428dbe1]
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so(_ZN6SCIRun9FieldInfo7executeEv+0x91)
>  
> [0x428ee85]
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Network.so(_ZN6SCIRun6Module10do_executeEv+0xc9)
>  
> [0xb78669]
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Network.so(_ZN6SCIRun12ModuleHelper3runEv+0xe8)
>  
> [0xb6aad0]
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libCore_Thread.so(_ZN6SCIRun6Thread8run_bodyEv+0x12)
>  
> [0xadd1be]
> /usr/local/SCIRun/bin/lib/libCore_Thread.so [0xae1b20]
> /lib/tls/libpthread.so.0 [0xa221d5]
> /lib/tls/libc.so.6(__clone+0x5a) [0x6aa2da]
>  1555392: main (state = blocking on semaphore, main wait)
>  16313264: internal service manager (detached, state = blocking, 
> connection_list_condition_variable)
>  79657904: TCL main event loop (detached, state = running)
>  8014768: Scheduler (daemon, detached, state = blocking, NetworkEditor 
> request FIFO, Mailbox empty condit ion)
>  32549808: SampleStructHex (state = blocking, Module execution FIFO, 
> Mailbox empty condition)
>  32684976: FieldInfo (state = running)
> 
> Abort signalled by pid: 3638
> Occured for thread: "FieldInfo"
> resume(r)/dbx(d)/cvd(c)/kill thread(k)/exit(e)?
> 
> 
> As I'm a Linux beginner (I started to use it to use SCIRun), I'ld like 
> to know if it already happens to somebody else or what to do to avoid 
> the crash.
> 
> Thanks a lot and kind regards from Switzerland
> 
> G. Walckiers
> 
> 
> ===========================================================================
> == The SCIRun Users mailing list: send email to majordomo@sci.utah.edu   ==
> == for more details.                                                     ==
> == Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:          ==
> ==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib         ==
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