SCIRun User Mailing List

Text archives Help

[SCIRUN-USERS] Re: Loss of Data when using matlab data in scirun

Chronological Thread 
  • From: Darrell Swenson <>
  • To: Yagna Pathak <>
  • Cc:
  • Subject: [SCIRUN-USERS] Re: Loss of Data when using matlab data in scirun
  • Date: Wed, 21 Sep 2011 10:36:12 -0600

I am not sure that I am clear on what you are trying to do, but it sounds 
like you are clipping a FE mesh based on data located at the nodes.  This can 
be tricky because in a FE mesh you often times cannot simply remove one node, 
you have to remove the whole element or nothing at all.  So to avoid this you 
could convert your mesh to a point cloud (ConvertMeshtoPointCloud) and then 
clip the mesh based on the data.  This should give you the right number of 
nodes, but it will no longer be on a FE mesh.


On Sep 21, 2011, at 10:22 AM, Yagna Pathak wrote:

> Hi,
> I have a vector of non-binary values that was generated in matlab. The 
> indices of this vector are the node values that correspond to the pial 
> surface. I then read it into scirun with the ReadMatrix and SetFieldData. 
> When I try to display my individual patches from the vector with 
> ClipFieldbyFunction, I tend to lose many of my nodes. How can I fix this 
> problem? I checked on matlab, I should have around 3700 nodes, but with 
> SCIRUN, I only get a display of 3300 nodes. 
> Thanks,
> Yagna Pathak

Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page