SCIRun User Mailing List

Text archives Help

[SCIRUN-USERS] Re: SCIRun 3.0.2 freezing inexplicably

Chronological Thread 
  • From: Ayla Khan <>
  • To: Layla Houshmand <>
  • Cc:
  • Subject: [SCIRUN-USERS] Re: SCIRun 3.0.2 freezing inexplicably
  • Date: Mon, 4 Jun 2012 10:38:50 -0400

Hi Layla,

Can you tell us which module is the one you need that isn't available in 
SCIRun 4?

SCIRun 3 is no longer supported, but we can try to reproduce your error - 
please also let us know which CentOS version you are using and whether it's 
32 or 64 bit. Also, a test network would be helpful.

We (the SCIRun developers) will be out of the office all this week, but we 
can try to reproduce your system next week.


On Jun 1, 2012, at 11:50 AM, Layla Houshmand wrote:

> Hi everyone,
> I am pretty new to SCIRun.  I use SCIRun v3.0.2 (on CentOS) because I need 
> to use a module that doesn't exist in newer versions.  Several months ago, 
> I had no trouble running programs with this version.  But now, programs I 
> have not edited in any way will not run properly.  One particular program 
> solves FEM Voltage solutions in space and then isosurfaces a certain 
> thresholded voltage.  When I try running this, SCIRun simply freezes, but 
> the Terminal window on CentOS reveals some errors.  Below I've copied and 
> pasted some of the messages that look especially strange: 
> Abort signalled by pid: 6299
> Occured for thread: "OpenGL: 
> .uiSCIRun_Render_ViewScene_0-ViewWindow_0.wframe.draw"
> Unrecognized option, exiting
> Exiting
> Thread "main"(pid 6299) caught signal SIGINT (interrupt)
> Backtrace:
> /usr/local/SCIRun_v3.0.2_dyn/bin/lib/ [0x2ace72c3ba99]
> /lib64/ [0x31218302d0]
> /lib64/ [0x312240cd21]
> /usr/local/SCIRun_v3.0.2_dyn/bin/lib/
>  [0x2ace72c3b502]
> scirun3(main+0x28a) [0x405bda]
> /lib64/ [0x312181d994]
> scirun3(__gxx_personality_v0+0x351) [0x403129]
> 47066332150944: main (state = blocking on semaphore, main wait)
> 1098815808: internal service manager (detached, state = blocking, 
> connection_list_condition_variable)
> 1099082048: Scheduler (daemon, detached, state = blocking, NetworkEditor 
> request FIFO, Mailbox empty condition)
> 1100134720: TCL main event loop (detached, state = blocking on mutex, TCL 
> Thread Lock)
>   1143048512: OpenGL: .uiSCIRun_Render_ViewScene_0-ViewWindow_0.wframe.draw 
> (state = blocking on mutex, CleanupManager lock)
> Abort signalled by pid: 6299
> Occured for thread: "main"
> Unrecognized option, exiting
> Exiting
> Attached is a document where I copied and pasted everything from the 
> Terminal Window.  Can anybody make sense of these error messages?  I 
> recently reinstalled SCIRunv3.0.2 hoping this would fix my problem, but it 
> has not.
> Thanks in advance!
> Layla
> -- 
> Layla Houshmand, Ph.D. Candidate
> Department of Biomedical Engineering, University of Michigan
> <SCIRunV3.0.2ErrorMsg.doc>

Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page