-
Jess Tate
Rob MacLeod
SCI Seg3D Mailing List
Text archives Help
- From: Michael Callahan <callahan@sci.utah.edu>
- To: seg3d@sci.utah.edu
- Subject: [Seg3D] Re: usage of the Intensity Correction filter
- Date: Thu, 02 Apr 2009 11:44:56 -0600
If you want to send me your data file I can take a look at it when I get
a chance.
Michael
On Wed, 2009-04-01 at 11:44 +0100, Ramón Casero Cañas wrote:
> Hi,
>
> I'm trying to apply the Intensity Correction filter, but the resulting
> volume has values out of range (nan), both for the minimum and maximum.
>
> I'm running the development version of Seg3D, Rev 43920.
>
> I'm using a size 460 x 415 x 900 MRI volume with intensity values
> between 1 and 35609. Spacing is 2.5e-5, 2.5e-5, 2.4e-5, and Origin is
> 8.6e-3, 6.2e-3, 9.8e-4.
>
> I'm using the default parameters Order=3 and Edge=0.1.
>
> Is this a problem with the parameters I chose? Where could I find some
> documentation about the usage of the filter and the meaning of the
> parameters?
>
> The console output when I run the filter is
>
> <SCREEN>
> $
> /home/foo/SCIRun/InsightToolkit-3.10.1/Utilities/vxl/core/vnl/algo/vnl_svd.txx:
>
> suspicious return value (19) from SVDC
> /home/foo/SCIRun/InsightToolkit-3.10.1/Utilities/vxl/core/vnl/algo/vnl_svd.txx:
>
> M is 19x19
> M = [ ...
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan nan
> nan nan nan ]
> </SCREEN>
>
>
> Best regards,
>
> Ramon.
>
- [Seg3D] usage of the Intensity Correction filter, Ramón Casero Cañas, 04/01/2009
- [Seg3D] Re: usage of the Intensity Correction filter, Ramón Casero Cañas, 04/01/2009
- [Seg3D] Re: usage of the Intensity Correction filter, Michael Callahan, 04/02/2009
- [Seg3D] Re: Re: usage of the Intensity Correction filter, Ramón Casero Cañas, 04/06/2009
Archive powered by MHonArc 2.6.16.
