SCI Seg3D Mailing List

Text archives Help


[Seg3D] RE: Re: Is there a way to generate 3D data for modeling from Seg3D


Chronological Thread 
  • From: "Wu, Yue" <yuewu@anl.gov>
  • To: <seg3d@sci.utah.edu>
  • Subject: [Seg3D] RE: Re: Is there a way to generate 3D data for modeling from Seg3D
  • Date: Fri, 15 May 2009 12:19:19 -0500
Hi Michael,
     I am able to generate a surface model from the segmentation file
(nrrd) using Slicer (slicer.org).
     My question is that for each layers of the segmentation mask data,
is there any specific value which assigns to each layer? Is there a way
to change the value?

Thanks,

Yue


-----Original Message-----
From: Michael Callahan [mailto:callahan@sci.utah.edu] ;
Sent: Tuesday, May 12, 2009 9:28 AM
To: seg3d@sci.utah.edu
Subject: [Seg3D] Re: Is there a way to generate 3D data for modeling
from Seg3D

Seg3D is a volume segmenter.  It marks up volumes based upon the labels
you assign.  You will need an additional meshing program to then convert
those labeled volumes into quality surface models.  Does anyone else
have any good meshing program recommendations?

  Michael

 On Mon, 2009-05-11 at 10:28 -0500, Wu, Yue wrote:
> Hi all,
>      I am new to Seg3D (not only Seg3D, but also analyzing medical 
> medical images in 3D). I have a fundamental question.
>      I am using parallel CT images to obtain the 3D structure data of 
> a heart. The 3D structure data will be used in finite element method 
> for simulation of a new recipe. I followed the tutorial and segmented 
> my data, generated the nrrd file. How do I export to a 3D space file?
> Currently I am hoping to get STL file format.
> 
> Thanks,
> 
> Yue


Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page