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[Seg3D] Re: saving the seeds (spline control points)


Chronological Thread 
  • From: Michael Callahan <callahan@sci.utah.edu>
  • To: seg3d@sci.utah.edu
  • Subject: [Seg3D] Re: saving the seeds (spline control points)
  • Date: Tue, 27 Oct 2009 18:34:05 -0600

There are not currently any tools that save and restore auxiliary data
like the splines.  As such there isn't currently a model for how that
interaction should work.  It's also non-trivial to set this up so that
it's a general purpose and easy to use mechanism.

If you are just needing the control points for your own purposes then
your best bet would be to make a 'export' button on the tool that calls
a function which just writes curves.txt or similar, and then use that
externally.

  Michael

On Tue, 2009-10-27 at 02:07 +0000, Ramón Casero Cañas wrote:
> Hi all,
> 
> The new Spline Tool I've been working on with your help over the last 5 
> weeks seems to pretty much do what it should (other than a couple of 
> glitches).
> 
> Now the only thing I'm missing is how to save the coordinates of the 
> spline control points to a file (possibly text?) in an elegant way, so 
> that it's well integrated with the application. I'd really appreciate 
> suggestions, thanks! :)
> 
> 
> An overview of features in the tool (feedback welcome too):
> 
> * One can add control points (seeds) sequentially or let the tool order 
> them using the azimuth value.
> 
> * The control points (seeds) can be linked with straight lines or using 
> a periodic interpolating cubic spline, with a centripetal scheme knot 
> vector (same spline as Matlab's CSCVN function).
> 
> * The spline can be transferred to a label mask. This gives the 
> physiologist visual feedback of the intersection points of the spline 
> with each plane
> 
> * One can select a radius value, and when the spline is being 
> transferred to the mask, then it's also dilated (it uses the 
> ITKBinaryDilateErodeImageFilterTool). This is slower, but it makes the 
> segmentation more visible.
> 
> The latest patch 
> (20091027-014200-spline-contour-segmentation-no-gaps-dilate.diff) can be 
> downloaded from here
> 
> http://paracommunications.org/wiki/index.php/Adding_a_new_filter_to_Seg3D#Milestones
> 
> Best regards,
> 
> Ramon.
> 




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