SCI Seg3D Mailing List

Text archives Help


[Seg3D] Re: [bug] Max value when loading segmentation from .mha file


Chronological Thread 
  • From: Ayla Khan <ayla@sci.utah.edu>
  • To: seg3d@sci.utah.edu
  • Subject: [Seg3D] Re: [bug] Max value when loading segmentation from .mha file
  • Date: Wed, 29 Feb 2012 11:00:20 -0700

Hi Ramon,

Thank you for pointing this bug out. We are working on fixing the remaining 
file import bugs.

Ayla

On Feb 28, 2012, at 8:04 AM, Ramón Casero Cañas wrote:

> 
> Hi,
> 
> When loading the attached .mha file in Seg3D2 (latest revision), "Import 
> layer from single file" -> Import file as Single Mask", clicking on "i" for 
> information shows that the segmentation has
> 
> Min: 0   Max: 0
> 
> However, the maximum value of the data in the file is 1. In fact, clicking 
> on button "Calculate" shows Pixels: 15.
> 
> 
> On a related bug, Volume shows 0.000 for lack of precision. It would be 
> better to have a number in 1e-6 format, so that small microscopy volumes 
> can be measured too ;)
> 
> Best regards,
> 
> Ramon.
> 
> -- 
> Dr. Ramón Casero Cañas
> 
> Computational Biology
> Department of Computer Science
> University of Oxford
> Wolfson Building, Parks Rd
> Oxford OX1 3QD
> 
> tlf     +44 (0) 1865 610737
> web     http://www.cs.ox.ac.uk/people/Ramon.CaseroCanas
> photos  http://www.flickr.com/photos/rcasero/
> <foo.mha>




Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page