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[Seg3D] Re: Fix for 2.1.4 segfault in Ubuntu Precise


Chronological Thread 
  • From: Robert Blake <rob.c.blake.3@gmail.com>
  • To: seg3d@sci.utah.edu
  • Subject: [Seg3D] Re: Fix for 2.1.4 segfault in Ubuntu Precise
  • Date: Wed, 05 Feb 2014 01:11:52 -0500
A quick followup:

A permanent fix would involve giving users the option of using the
system's libfreetype instead of Seg3D's libfreetype on Linux. 

Would you be interested if I wrote a patch so that Linux users could use
their package-installed libraries instead of Seg3D's Externals
directory? This might make package maintainers happy-- I'd love to see
Seg3D included in the debian and fedora repositories.  See

https://lists.debian.org/debian-med/2013/05/msg00052.html

for the relevant discussion last year on the debian lists.

On 02/05/2014 01:08 AM, Robert Blake wrote:
> Hi everyone,
>
> I'm a big fan of Seg3D, but over the last year+ I've noticed some
> instability in the Linux version on Ubuntu precise, 12.04.  Seg3D tends
> to crash intermittently when opening up any file dialog.
>
> Someone has already filed a bug report for this bug-- this is the same
> behavior that I am seeing:
> https://gforge.sci.utah.edu/gf/project/seg3d2/tracker/?action=TrackerItemEdit&tracker_id=710&tracker_item_id=772
>
>
> jeoren checked in the following fix for this:
> https://gforge.sci.utah.edu/svn/seg3d2/trunk@1708
>
> However, this fix doesn't actually solve the problem.
>
> As far as I can tell, the the problem occurs when Seg3D tries to load a
> native file dialog on Ubuntu.  This causes a gtk-2 file dialog to
> appear, which in turn uses libfreetype to render the dialog.  Ubuntu's
> gtk-2 libraries expect to use the updated Ubuntu libfreetype libraries,
> but instead they access Seg3D's internal statically linked libfreetype
> library instead.  This causes intermittent invalid memory accesses.
>
> I've attached a patch for 2.1.4 that DOES seem to solve the problem once
> and for Linux, although it is an ugly kludge.  I replaced all of the
> native file dialogs with Qt file dialogs.  I've been using this version
> heavily for 1 week and it hasn't segfaulted once.
>
> Sending this patch here in case someone else has the same problem.
> Rob
>


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