cleaver software mailing list

Text archives Help


[Cleaver] Re:


Chronological Thread 
  • From: Joshua Levine <jlevine@sci.utah.edu>
  • To: Ricardo Ortiz <ricardo.ortiz@kitware.com>
  • Cc: cleaver@sci.utah.edu
  • Subject: [Cleaver] Re:
  • Date: Sun, 22 Sep 2013 13:10:41 -0400
Hi Ricardo,

For your particular dataset, you'll need a separate nrrd file for each
indicator function.  You've given us the label map, where each voxel
is labeled by material.  What cleaver expects is a distance field per
label, as in the frog example you can find on the cleaver website.

Converting between the two is not super tricky, and is in fact
something we've discussed supporting in the code itself.  Jonathan
Bronson might in fact have this feature hidden in a development
version of Cleaver.  I believe this is the currently unimplemented
"loadNRRDLabelMap()" function in release 1.5.3.

Regards,
Josh

On Fri, Sep 20, 2013 at 9:15 AM, Ricardo Ortiz
<ricardo.ortiz@kitware.com> wrote:
> Hello,
>
> We are testing cleaver to generate a mesh on the following volumetric
> dataset. I get the following output:
>
>> Input Dimensions: 128 x 170 x 335
>> Creating Mesh with Volume Size [128, 170, 335]
>> ...
>> Worst Angles:
>> min: 180
>> max: 0
>> Writing settings file: man-arm-2mm-3labels-clean.info
>> ...
>> Cleaning up.
>> Done.
>
>
> Note the max worst angle is 0.  There is no error message nor warning and
> the output files are pretty much empty.
> Is there something I am missing parameter wise?
> I am using the defaults for -as and -al.
>
> Any help will be very much appreciated.
>
> Thanks,
> /Ricardo
>
> --
> Ricardo Ortiz, Ph.D.
> R&D Engineer
> Kitware, Inc.
> 101 East Weaver St. G4
> Carrboro, NC 27510
> Phone: (919) 869-8870
> Fax: (919) 969-6910
>

Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page