Text archives Help

---

David Koontz <davidakoontz@gmail.com> writes:
> I sent some crash reports back to you via the tool - with data sets.

Thanks!

-tom

> On Oct 17, 2009, at 7:32 PM, tom fogal wrote:
> 
> > <david@koontz.name> writes:
> >> I have MRI images of my brain - but when I try to load them into
> >> iv3d the 3d image appears to be an "exploded - assembly" type of
> >> image.  By that I mean it looks more like a image of a hamburger
> >> with the bun floating above the pickles floating above the tomato
> >> above the beef above the bun.  To be speckic the ventricals are on
> >> top of the stack of brain parts.  Weird.
> >
> > `This is your brain on drugs.'
> >
> > Seriously though -- that does sound quite strange.  My guess is
> > that you're hitting a bug.
> >
> >> It was converted from a CD of MRI data from 2002 -
> >>
> >> How do I tell what data types iv3d can and cannot convert?
> >
> > You could filter by file extensions in the file loader box.  For
> > more details though, we list and discuss the supported file formats
> > in the manual:
> >
> >  http://www.sci.utah.edu/images/docs/imagevis3d.pdf
> >
> > Loading data is discussed on page 13.
> >
> >
> > I don't think the file format is the issue though; sounds like
> > it's just a bug in the DICOM parser.  Since you've got an MRI of a
> > brain, I'd guess you've got a DICOM or a set of DICOMs, so there
> > might just be a bug in the DICOM parser.
> >
> > Is there any chance you could send us the data files?
> >
> > The best way to report a bug is to use the "Report an Issue"
> > dialog.  This is discussed on page 37 of the aforementioned manual.
> > Please do report an issue via this dialog, even if you don't
> > feel comfortable sending us the data files.  The main reason
> > for using this dialog is the "Submit Debug Log" checkbox, which
> > (when checked) gives us detailed information on the data file's
> > specifications.  If you are comfortable sending us the data, there
> > is a method to submit data files in that dialog.
> >
> > Please note that there are privacy concerns associated with sending
> > DICOMs to other people.  One way to mitigate this problem is to
> > anonymize your DICOM before sending it; SCI provides no such tool,
> > but a quick google search for "dicom anonymizer" looked promising.
> > Of course, this point's a bit moot given we know what kind of data
> > you'd be sending...
> >
> >> How does one know what type of data file they have - are there
> >> magic strings in the data file?
> >
> > Generally, yes.  Usually the first few bytes are enough to figure
> > it out.  A quick scan of the DICOMs I have suggest that the first 3
> > bytes of all DICOMs are the three characters "DIC", but I haven't
> > verified this (e.g. by looking at any of the DICOM specs).

---

• [IV3D-USERS] Wow - there's my brain, david, 10/17/2009
  • [IV3D-USERS] Re: Wow - there's my brain, tom fogal, 10/17/2009
    • [IV3D-USERS] Re: Re: Wow - there's my brain, David Koontz, 10/17/2009
      • [IV3D-USERS] Re: Re: Re: Wow - there's my brain, tom fogal, 10/18/2009

---

Archive powered by MHonArc 2.6.16.