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Re: [MANTA] bad exit from bin/manta on Altix


Chronological Thread 
  • From: James Bigler <bigler@cs.utah.edu>
  • Cc: manta@sci.utah.edu
  • Subject: Re: [MANTA] bad exit from bin/manta on Altix
  • Date: Wed, 25 May 2005 16:30:20 -0600
Can you build manta with GCC instead of ICC, since this is an ICC specific library?

James

Rocky Rhodes wrote:
Ok.  Got me there.  .../intel-cc/8.1.030/lib/libipr.so.6 is the culprit.

        Rocky


-----Original Message-----
From: owner-manta@sci.utah.edu [mailto:owner-manta@sci.utah.edu] On Behalf
Of James Bigler
Sent: Wednesday, May 25, 2005 3:06 PM
Cc: manta@sci.utah.edu
Subject: Re: [MANTA] bad exit from bin/manta on Altix

Doing a google on those files indicates that libffio.so is a Fortran
library commonly found on SGI machines.  libeag_ffio.so also appears to
be an SGI oriented library.

Try this for me:

ldd bin/manta | awk '{print $3}' | \
xargs --max-args=1 grep -l "Incorrect Phase"

James

Rocky Rhodes wrote:

It still fails the same way on exit.

Another clue (red herring?) is that the "Incorrect Phase" error message

is

coming from either libffio.so or libeag_ffio.so on the Altix.  These are

the

only two .so files in /usr/lib that contain this string.

        Rocky



-----Original Message-----
From: owner-manta@sci.utah.edu [mailto:owner-manta@sci.utah.edu] On

Behalf

Of James Bigler
Sent: Wednesday, May 25, 2005 11:08 AM
Cc: manta@sci.utah.edu
Subject: Re: [MANTA] bad exit from bin/manta on Altix

Rocky,

Can you try something for me?  The only thread code that is specific to
the altix is the barrier code.  In Thread_pthread.cc there are a few
places that use __ia64__.  Could you replace these with __ia64_noway__
to see if you still have problems (I want to not compile the ia64
specific code here)?

Thanks
James



I had tried older versions of the main trunk and didn't have any luck
isolating a change.  I tried versions back to 308 that all failed

similarly,



and version 300 doesn't build for me.  It has probably always been

this

way



and I just had this environment variable set when I tried it before.

        Rocky





-----Original Message-----
From: owner-manta@sci.utah.edu [mailto:owner-manta@sci.utah.edu] On

Behalf



Of James Bigler
Sent: Tuesday, May 24, 2005 7:59 PM
Cc: manta@sci.utah.edu
Subject: Re: [MANTA] bad exit from bin/manta on Altix

You could try checking out an older version and see if it happens.

The Thread_pthread.cc file is pretty hairy.  The altix is the only
machine we've had complaints about, though.  Should this be showing

up

in other modern distributions?  What do the SGI docs say about that?

James

Rocky Rhodes wrote:




If I run "bin/manta -bench 10 10 -imagedisplay null -np 2" on an

Altix,


the program exits in a bad way, complaining of "ERROR: Incorrect

Phase"


and then telling me that "Thread 'idle or main'" got a SIGSEGV.  If

I

run this again with the LD_ASSUME_KERNEL environment variable set

to

"2.4.19" it exits cleanly.



SGI's documentation says that this behavior is indicative of an
application "which depends on behaviors in which the LinuxThreads
implementation deviates from the POSIX standard".  The

LD_ASSUME_KERNEL


environment variable forces the application to use the old

LinuxThreads


implementation rather than NPTL (Native POSIX Thread Library).  I

think


the new thread package was included with ProPack 3.0 on the Altix.

You


might not see this problem on your Altix if it is running an

earlier

version of the system software.



I thought I had tried this earlier and didn't have this problem,

but

as


it is just an environment variable, now I'm wondering if this has

always



been broken this way.  Is anyone aware of any changes in the

pthread

code made over the last week or so that may have changed this

behavior?


Does anyone feel more qualified than I do about mucking around in

this


code and trying to understand what goes on when the program exits?



        Rocky






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