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Re: [SCIRUN-USERS] 3d Matlab matrix


Chronological Thread 
  • From: "Elisha Hughes" <erh0509@westminstercollege.edu>
  • To: <scirun-users@sci.utah.edu>
  • Cc: <jeroen@cvrti.utah.edu>
  • Subject: Re: [SCIRUN-USERS] 3d Matlab matrix
  • Date: Wed, 13 Apr 2005 05:57:01 -0600
Unfortunately I am having trouble using the 
MatlabInterface::DataIO::MatlabMatricesReader. When I try to connect the 
matrix to an output port by clicking the port buttons in the gui, the 
following module log message is generated:

REMARK: Matrix 'Ds' cannot be translated into a SCIRun Matrix (dimensions > 2)

Is there something I am missing? Does this module work for 3d matrices?

Thank you for your help,
Elisha



>>> Jeroen Stinstra <jeroen@cvrti.utah.edu> 04/10/05 3:46 PM >>>
Hi,

The matlabinterface will do that for you. Use  
MatlabInterface::DataIO::MatlabMatricesReader to make a 3D matrix into  
a LatVolField, Or use MatlabInterface::DataIO::MatlabNrrdsReader to  
make it into a 3D nrrd object which can be converted as well to any  
other object. Just make sure you have the latest version, I think part  
of the converter did not work properly under version 1.23. Save the  
matrix as a file and you can directly read it this way in SCIRun

Jeroen



On Apr 10, 2005, at 0:34, David Weinstein wrote:

> Hi Elisha,
>
> I believe you can turn a 3D matrix into a LatVolField with the  
> MatlabInterface::DataIO::Matlab module.  Jeroen (Cc'ed) can probably  
> tell you more...
>
> Cheers,
> Dave
>
>
> On Apr 9, 2005, at 9:23 AM, Elisha Hughes wrote:
>
>> Dear scirun-users,
>>
>> Is there some way that I can get a 3D matrix from matlab into SCIRun  
>> for visualization?
>>
>> Thank you for your help,
>> Elisha
>>
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>> == The SCIRun Users mailing list: send email to  
>> majordomo@sci.utah.edu   ==
>> == for more details.                                                   
>>    ==
>> == Please acknowledge use of SCIRun in your papers and reports:        
>>    ==
>> ==   see http://software.sci.utah.edu/scirun-biopse_citation.bib       ;
>>    ==
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Jeroen Stinstra

University of Utah
Nora Eccles Harrison CardioVascular Research and Training Institute
Room 207
95 South 2000 East
Salt Lake City, UT 84112-5000

e-mail:  jeroen@cvrti.utah.edu
telephone: 801-587-9508

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