Text archives Help

---

Hi Ramon,

We don't have export support for the MetaImage format, but it looks like it 
should be available through ITK - I can look into it.

Can you send me some test data or point me to a Seg3D project for testing?

Thanks,

Ayla

On Jan 24, 2012, at 1:40 PM, Ramón Casero Cañas wrote:

> 
> Hi all,
> 
> I have a microscopy image in MetaImage format (.mha) with
> 
> Offset = 0.000063 -0.000063 -0.000003
> ElementSpacing = 0.000000439453 0.000000439453 0.000006378000
> 
> If I open it in Seg3D2, I cannot export to mha format (it doesn't seem to 
> be available). If I export to NRRD format, the spacing values get truncated 
> too early, and the information is lost.
> 
> In addition, I'm not too sure why the last value of Offset and axis mins 
> are different.
> 
> spacings: 0.000000 0.000000 0.000006
> axis mins: 0.000063 -0.000063 -0.000006
> 
> Best regards,
> 
> Ramon.
> 
> -- 
> Dr. Ramón Casero Cañas
> 
> Computational Biology
> Department of Computer Science
> University of Oxford
> Wolfson Building, Parks Rd
> Oxford OX1 3QD
> 
> tlf     +44 (0) 1865 610737
> web     http://www.cs.ox.ac.uk/people/Ramon.CaseroCanas
> photos  http://www.flickr.com/photos/rcasero/

---

• [Seg3D] [bug] Truncation of Spacing and axis mins values in NRRD export, Ramón Casero Cañas, 01/24/2012
  • [Seg3D] Re: [bug] Truncation of Spacing and axis mins values in NRRD export, Ayla Khan, 01/26/2012
    • [Seg3D] Re: Re: [bug] Truncation of Spacing and axis mins values in NRRD export, Ramón Casero Cañas, 01/28/2012

---

Archive powered by MHonArc 2.6.16.