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[Seg3D] RE: export segmentations?


Chronological Thread 
  • From: Spencer Clegg <sclegg@numirabio.com>
  • To: "seg3d@sci.utah.edu" <seg3d@sci.utah.edu>
  • Subject: [Seg3D] RE: export segmentations?
  • Date: Tue, 17 Feb 2009 22:47:45 -0600
  • Accept-language: en-US
  • Acceptlanguage: en-US

Just click File> Export Segmentation.  Then open it as a volume in your 
program of choice.  Using a ITK filter (such as confidence connector, etc.), 
you can create a segmented marker from the volume.  

My question is how/when is there going to be a stable release of Seg3D?

Cheers,

Spencer

-----Original Message-----
From: Dylan Morris [mailto:dmorris@caltech.edu] ;
Sent: Tuesday, February 17, 2009 6:46 PM
To: seg3d@sci.utah.edu
Subject: [Seg3D] export segmentations?


Hi List,

I was wondering if someone could tell me how I might export my  
segmentations? I saw this listed as a crucial future feature; any idea  
when to expect it? In the meantime, is anyone aware of a workaround?  
Can I export the segmentation as a volume mask and then create the  
isosurface in another program?

Thanks,
Dylan

Dylan Morris
Graduate Student
Biochemistry and Molecular Biophysics
California Institute of Technology
MC 114-96, 1200 E California Blvd
Pasadena, CA 91125

e: dmorris@caltech.edu
o: 626.395.3056




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