iv3d-users

Text archives Help


[IV3D-USERS] Re: Re: Re: NRRD import


Chronological Thread 
  • From: tom fogal <tfogal@alumni.unh.edu>
  • To: iv3d-users@sci.utah.edu
  • Subject: [IV3D-USERS] Re: Re: Re: NRRD import
  • Date: Thu, 21 Jan 2010 11:43:58 -0700
Tim Holy <holy@wustl.edu> writes:
> On Thursday 21 January 2010 10:45:13 am Jens Krueger wrote:
> > Currently dat/raw pairs (Qvis) are the only supported way of
> > getting RGBA into imagevis3d. If you can write your data into nrrd,
> > you can also easily create QVis files.
[snip]
> However, the documentation of the format on this page
> http://openqvis.sourceforge.net/docu/fileformat.html seems not to
> specify anything about the order of color values in the file.  Should
> it be all 4 RGBA values for the first pixel, then all 4 for the
> second pixel, etc? Or should it be the red channel for the whole
> volume, followed by the green channel for the whole volume, etc?

It should be RGBA, RGBA, RGBA, etc.

Here's a QVis format header that I use to load up an RGBA dataset into
ImageVis3D:

  ObjectFileName: fullbody1728x1008x1878_old.raw
  TaggedFileName: ---
  Resolution:     1728 1008 1878
  SliceThickness: 1 1 3
  Format:         UCHAR4
  NbrTags:        0
  ObjectType:     TEXTURE_VOLUME_OBJECT
  ObjectModel:    RGBA
  GridType:       EQUIDISTANT

You should hopefully be able to just change the filename and use that
file.  Place it in a .dat file so that ImageVis3D will recognize it as
QVis format.

-tom

> > Am 21.01.2010 um 17:40 schrieb Tim Holy:
> > > Hi again,
> > >
> > > In experimenting further with NRRD import, it also appears that the NRRD
> > > importer does not make use of the "space directions" tag. Consequently,
> > > the user has to manually enter the spacing along each coordinate axis.
> > > There are a number of other NRRD0004 features that could also be of
> > > potential interest.
> > >
> > > If I'm not barking up the wrong tree in terms of choosing NRRD as a data
> > > interchange format (i.e., with respect to my previous post re RGBA
> > > support), there's a chance I can help with simple bugfixes/extensions
> > > (obviously, in consultation with those who have developed iv3d in the
> > > first place!).
> > >
> > > Best,
> > > --Tim
> > 

Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page