iv3d-users

Text archives Help


[IV3D-USERS] Re: Re: Re: Re: Re: NRRD import


Chronological Thread 
  • From: tom fogal <tfogal@alumni.unh.edu>
  • To: iv3d-users@sci.utah.edu
  • Subject: [IV3D-USERS] Re: Re: Re: Re: Re: NRRD import
  • Date: Thu, 21 Jan 2010 13:00:03 -0700
Tim Holy <holy@wustl.edu> writes:
> On Thursday 21 January 2010 12:43:58 pm tom fogal wrote:
> > It should be RGBA, RGBA, RGBA, etc.
> > 
> > Here's a QVis format header that I use to load up an RGBA dataset into
> > ImageVis3D:
> 
> Many thanks! The "UCHAR4" part of this header was a particularly helpful 
> tip.
> 
> I have verified that I can load a "scalar" qvis file just fine (using
> UCHAR f or the format in the header). However, if I try to load an
> RGBA, I get a crash with this message on the command line:
>
> terminate called after throwing an instance of 'std::length_error'
>   what():  basic_string::resize

Yikes!  That's a harsh one.

> Here is my header file:
[snip]
> and note that the .raw file is of the correct size (4*5*10*4):
[snip]

Thanks!  I generated 800 bytes of garbage data and loaded it up with
your header file.  It is, indeed, crashing.  Sorry about that.

I will take a look at this and get back to you once I've determined
what's going wrong.

> This is using a freshly-downloaded version of iv3d (.tar.gz format).
>
> Any thoughts? I can send my .raw file (not attaching it because I
> don't know if you like attachments on this list, but note it's only
> 800 bytes). It just contains values that are either 0 or 255.

I do not need it in this case, but for future reference && to document
it for the archives: small files as mentioned here are fine for the
list.  For larger files, please use the `report an issue' dialog.

-tom

> > You should hopefully be able to just change the filename and use that
> > file.  Place it in a .dat file so that ImageVis3D will recognize it as
> > QVis format.
> > 
> > -tom
> > 
> > > > Am 21.01.2010 um 17:40 schrieb Tim Holy:
> > > > > Hi again,
> > > > >
> > > > > In experimenting further with NRRD import, it also appears that the
> > > > > NRRD importer does not make use of the "space directions" tag.
> > > > > Consequently, the user has to manually enter the spacing along each
> > > > > coordinate axis. There are a number of other NRRD0004 features that
> > > > > could also be of potential interest.
> > > > >
> > > > > If I'm not barking up the wrong tree in terms of choosing NRRD as a
> > > > > data interchange format (i.e., with respect to my previous post re
> > > > > RGBA support), there's a chance I can help with simple
> > > > > bugfixes/extensions (obviously, in consultation with those who have
> > > > > developed iv3d in the first place!).
> > > > >
> > > > > Best,
> > > > > --Tim

Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page