SCIRun User Mailing List

Text archives Help


[SCIRUN-USERS] Re: Starting SCIRun in OSX


Chronological Thread 
  • From: Ayla Khan <ayla@sci.utah.edu>
  • To: Felix Lucka <felix.lucka@uni-muenster.de>
  • Cc: scirun-users@sci.utah.edu
  • Subject: [SCIRUN-USERS] Re: Starting SCIRun in OSX
  • Date: Mon, 22 Oct 2012 11:31:25 -0600
Hi Felix,

I don't think you're seeing the same problem that Chris had - that was a bug 
in the script that starts SCIRun from the App bundle. This looks like a 
different bug.

What kind of mesh file are you opening when you get this crash?

Ayla

On Oct 17, 2012, at 2:01 PM, Felix Lucka wrote:

> Am 15.03.12 17:16, schrieb Chris Butson:
>> I've had intermittent problems starting SCIRun in OSX. The behavior is as 
>> follows: I double click the SCIRun application in a Finder window. It 
>> starts X11 (if it's not already running), then the SCIRun icon momentarily 
>> appears in the Dock, and then it disappears. SCIRun never starts. 
>> Sometimes I am able to work around this by opening new X11 terminal 
>> windows or closing existing windows. Sometimes I have to reboot the 
>> computer before SCIRun will start again. Has anyone else experienced this? 
>> Is there a workaround?
>> 
>> Details:
>> SCIRun 4.4 (though this behavior is reproducible with any version 4.x)
>> MacBook Pro running OSX 10.6.8
>> 
>> Thanks,
>> Chris
>> 
> 
> Any insights on that issue? I used to have it too with former versions of 
> SCIRun (also OS X 10.6.8.), but now with SCIRun 4.7. at least SCIRun always 
> starts. However, when I click on certain buttons, it crashes. The output 
> below is what it get, when I try to load a mesh by "file" --> "load". But 
> it also crashes with the  "UI" buttons of the modules. So it seem's there 
> are still unresolved issues with X11?
> 
> Best, Felix
> 
> 
> SHELL=/bin/bash
> SCIRUN_SRCDIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/src
> TMPDIR=/var/folders/Op/Op97LriYGB4oTB-m8VBWC++++TI/-Tmp-/
> Apple_PubSub_Socket_Render=/tmp/launch-JEtemb/Render
> WINDOWID=6291469
> XTERM_SHELL=/bin/bash
> USER=felix_lucka
> COMMAND_MODE=legacy
> TCL_LIBRARY=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/lib/tcl
> SSH_AUTH_SOCK=/tmp/launch-J3eAe4/Listeners
> __CF_USER_TEXT_ENCODING=0x1F5:0:3
> SCIRUN_ITCL_WIDGETS=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/lib/iwidgets/scripts
> PATH=/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin
> _=/usr/bin/env
> DBUS_FINK_SESSION_BUS_SOCKET=/tmp/launch-t8N5NQ/unix_domain_listener
> PWD=/
> SCIRUN_OBJDIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources
> XTERM_LOCALE=C
> XTERM_VERSION=XTerm(251)
> HOME=/Users/felix_lucka
> SHLVL=2
> LOGNAME=felix_lucka
> SCIRUN_THIRDPARTY_DIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources
> DISPLAY=/tmp/launch-bxu02C/org.x:0
> SCIRun version 4.7 revision 45572
> adding matlabengine
> adding matlabenginefiletransfer
> create network editor
> open sciruntcl
> Load Tcl 8.6
> Load Tk 8.6
> Load itcl 4.0
> Load itk 4.0
> Load Iwidgets 4.0.1
> Load BLT 2.4
> Done configuring TCL
> start network editor
> copy and parse .scirunrc
> scirun> X Error: BadValue (integer parameter out of range for operation)
> 
> Thread "main" (id: 0x7fff71083cc0, pid: 658)
>        caught signal SIGABRT (Abort)
>        ...handle_abort_signals...
> niceAbort
> 0x7fff71083cc0:main( RUNNING, List: )
> 0x104006000:internal service manager(detached,  RUNNING, List: )
> 0x104049000:Event Manager Thread(detached,  BLOCKING, EventManager, List: )
> 0x10408c000:Scheduler(daemon, detached,  BLOCKING, NetworkEditor request 
> FIFO, List: )
> 0x10418f000:TCL main event loop(detached,  RUNNING, List: )
> 
> Abort signalled by pid: 658
> Occured for thread: "main"
> Exiting
> bash: line 1:   658 Abort trap 
> "/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/bin/scirun"
> 
> 
> 
> -- 
> Dipl.-Math. Felix Lucka
> e-mail: felix.lucka@uni-muenster.de
> 
> Workgroup Imaging, Prof. Dr. Martin Burger
> Institute for Computational and Applied Mathematics, University of Muenster
> www: http://wwwmath.uni-muenster.de/num/burger/organization/lucka
> 
> Workgroup Methods in Bioelectromagnetism, PD. Dr. Carsten Wolters     
> Institute for Biomagnetism and Biosignalanalysis, University of Muenster
> www: http://campus.uni-muenster.de/index.php?id=919&L=1


Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page