SCIRun User Mailing List

Text archives Help


[SCIRUN-USERS] Re: Re: Starting SCIRun in OSX


Chronological Thread 
  • From: Ayla Khan <ayla@sci.utah.edu>
  • To: Felix Lucka <felix.lucka@uni-muenster.de>
  • Cc: scirun-users@sci.utah.edu
  • Subject: [SCIRUN-USERS] Re: Re: Starting SCIRun in OSX
  • Date: Tue, 23 Oct 2012 18:41:11 -0600
Hi Felix,

Can you tell me what X11 app version you're using, and also the graphics 
card? I have XQuartz 2.3.6 (xorg-server 1.4.2-apple56) installed on the OS X 
10.6.8 partition on my MacBook Pro with a AMD Radeon HD 6750M card.

Thanks,

Ayla

On Oct 22, 2012, at 11:47 AM, Felix Lucka wrote:

> Hi Ayla,
> 
> I can't get to the point where I can specify a certain mesh, SCIRun crashes 
> before the file browser launches (right after clicking on "Load" in the 
> drop-down menu "File". It's similar with the "UI" windows, SCIRun crashes 
> right after clicking on "UI" in the main window, it is not able to open the 
> new window properly.
> 
> Best, Felix
> 
> 
> 
> Am 22.10.12 19:31, schrieb Ayla Khan:
>> Hi Felix,
>> 
>> I don't think you're seeing the same problem that Chris had - that was a 
>> bug in the script that starts SCIRun from the App bundle. This looks like 
>> a different bug.
>> 
>> What kind of mesh file are you opening when you get this crash?
>> 
>> Ayla
>> 
>> On Oct 17, 2012, at 2:01 PM, Felix Lucka wrote:
>> 
>>> Am 15.03.12 17:16, schrieb Chris Butson:
>>>> I've had intermittent problems starting SCIRun in OSX. The behavior is 
>>>> as follows: I double click the SCIRun application in a Finder window. It 
>>>> starts X11 (if it's not already running), then the SCIRun icon 
>>>> momentarily appears in the Dock, and then it disappears. SCIRun never 
>>>> starts. Sometimes I am able to work around this by opening new X11 
>>>> terminal windows or closing existing windows. Sometimes I have to reboot 
>>>> the computer before SCIRun will start again. Has anyone else experienced 
>>>> this? Is there a workaround?
>>>> 
>>>> Details:
>>>> SCIRun 4.4 (though this behavior is reproducible with any version 4.x)
>>>> MacBook Pro running OSX 10.6.8
>>>> 
>>>> Thanks,
>>>> Chris
>>>> 
>>> 
>>> Any insights on that issue? I used to have it too with former versions of 
>>> SCIRun (also OS X 10.6.8.), but now with SCIRun 4.7. at least SCIRun 
>>> always starts. However, when I click on certain buttons, it crashes. The 
>>> output below is what it get, when I try to load a mesh by "file" --> 
>>> "load". But it also crashes with the  "UI" buttons of the modules. So it 
>>> seem's there are still unresolved issues with X11?
>>> 
>>> Best, Felix
>>> 
>>> 
>>> SHELL=/bin/bash
>>> SCIRUN_SRCDIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/src
>>> TMPDIR=/var/folders/Op/Op97LriYGB4oTB-m8VBWC++++TI/-Tmp-/
>>> Apple_PubSub_Socket_Render=/tmp/launch-JEtemb/Render
>>> WINDOWID=6291469
>>> XTERM_SHELL=/bin/bash
>>> USER=felix_lucka
>>> COMMAND_MODE=legacy
>>> TCL_LIBRARY=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/lib/tcl
>>> SSH_AUTH_SOCK=/tmp/launch-J3eAe4/Listeners
>>> __CF_USER_TEXT_ENCODING=0x1F5:0:3
>>> SCIRUN_ITCL_WIDGETS=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/lib/iwidgets/scripts
>>> PATH=/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin
>>> _=/usr/bin/env
>>> DBUS_FINK_SESSION_BUS_SOCKET=/tmp/launch-t8N5NQ/unix_domain_listener
>>> PWD=/
>>> SCIRUN_OBJDIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources
>>> XTERM_LOCALE=C
>>> XTERM_VERSION=XTerm(251)
>>> HOME=/Users/felix_lucka
>>> SHLVL=2
>>> LOGNAME=felix_lucka
>>> SCIRUN_THIRDPARTY_DIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources
>>> DISPLAY=/tmp/launch-bxu02C/org.x:0
>>> SCIRun version 4.7 revision 45572
>>> adding matlabengine
>>> adding matlabenginefiletransfer
>>> create network editor
>>> open sciruntcl
>>> Load Tcl 8.6
>>> Load Tk 8.6
>>> Load itcl 4.0
>>> Load itk 4.0
>>> Load Iwidgets 4.0.1
>>> Load BLT 2.4
>>> Done configuring TCL
>>> start network editor
>>> copy and parse .scirunrc
>>> scirun> X Error: BadValue (integer parameter out of range for operation)
>>> 
>>> Thread "main" (id: 0x7fff71083cc0, pid: 658)
>>>        caught signal SIGABRT (Abort)
>>>        ...handle_abort_signals...
>>> niceAbort
>>> 0x7fff71083cc0:main( RUNNING, List: )
>>> 0x104006000:internal service manager(detached,  RUNNING, List: )
>>> 0x104049000:Event Manager Thread(detached,  BLOCKING, EventManager, List: 
>>> )
>>> 0x10408c000:Scheduler(daemon, detached,  BLOCKING, NetworkEditor request 
>>> FIFO, List: )
>>> 0x10418f000:TCL main event loop(detached,  RUNNING, List: )
>>> 
>>> Abort signalled by pid: 658
>>> Occured for thread: "main"
>>> Exiting
>>> bash: line 1:   658 Abort trap 
>>> "/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/bin/scirun"
>>> 
>>> 
>>> 
>>> --
>>> Dipl.-Math. Felix Lucka
>>> e-mail: felix.lucka@uni-muenster.de
>>> 
>>> Workgroup Imaging, Prof. Dr. Martin Burger
>>> Institute for Computational and Applied Mathematics, University of 
>>> Muenster
>>> www: http://wwwmath.uni-muenster.de/num/burger/organization/lucka
>>> 
>>> Workgroup Methods in Bioelectromagnetism, PD. Dr. Carsten Wolters   
>>> Institute for Biomagnetism and Biosignalanalysis, University of Muenster
>>> www: http://campus.uni-muenster.de/index.php?id=919&L=1
>> 
> 
> -- 
> Dipl.-Math. Felix Lucka
> e-mail: felix.lucka@uni-muenster.de
> 
> Workgroup Imaging, Prof. Dr. Martin Burger
> Institute for Computational and Applied Mathematics, University of Muenster
> www: http://wwwmath.uni-muenster.de/num/burger/organization/lucka
> 
> Workgroup Methods in Bioelectromagnetism, PD. Dr. Carsten Wolters     
> Institute for Biomagnetism and Biosignalanalysis, University of Muenster
> www: http://campus.uni-muenster.de/index.php?id=919&L=1


Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page