SCIRun User Mailing List

Text archives Help


[SCIRUN-USERS] Re: Starting SCIRun in OSX


Chronological Thread 
  • From: Ayla Khan <ayla@sci.utah.edu>
  • To: Felix Lucka <felix.lucka@uni-muenster.de>
  • Cc: scirun-users@sci.utah.edu
  • Subject: [SCIRUN-USERS] Re: Starting SCIRun in OSX
  • Date: Fri, 26 Oct 2012 17:46:06 -0600
Hi Felix,

I haven't been able to reproduce the problem on my MacBook Pro.

Are there any other users with MacBook Airs who are seeing similar problems?

Thanks,

Ayla

On Oct 24, 2012, at 1:14 AM, Felix Lucka wrote:

> Hi Ayla,
> 
> I'm also using XQuartz 2.3.6 (xorg-server 1.4.2-apple56) and OS X 10.6.8 
> and I have a MacBook Air with a NVIDIA GeForce 320M graphics card.
> 
> BR, Felix
> 
> 
> Am 24.10.12 02:41, schrieb Ayla Khan:
>> Hi Felix,
>> 
>> Can you tell me what X11 app version you're using, and also the graphics 
>> card? I have XQuartz 2.3.6 (xorg-server 1.4.2-apple56) installed on the OS 
>> X 10.6.8 partition on my MacBook Pro with a AMD Radeon HD 6750M card.
>> 
>> Thanks,
>> 
>> Ayla
>> 
>> On Oct 22, 2012, at 11:47 AM, Felix Lucka wrote:
>> 
>>> Hi Ayla,
>>> 
>>> I can't get to the point where I can specify a certain mesh, SCIRun 
>>> crashes before the file browser launches (right after clicking on "Load" 
>>> in the drop-down menu "File". It's similar with the "UI" windows, SCIRun 
>>> crashes right after clicking on "UI" in the main window, it is not able 
>>> to open the new window properly.
>>> 
>>> Best, Felix
>>> 
>>> 
>>> 
>>> Am 22.10.12 19:31, schrieb Ayla Khan:
>>>> Hi Felix,
>>>> 
>>>> I don't think you're seeing the same problem that Chris had - that was a 
>>>> bug in the script that starts SCIRun from the App bundle. This looks 
>>>> like a different bug.
>>>> 
>>>> What kind of mesh file are you opening when you get this crash?
>>>> 
>>>> Ayla
>>>> 
>>>> On Oct 17, 2012, at 2:01 PM, Felix Lucka wrote:
>>>> 
>>>>> Am 15.03.12 17:16, schrieb Chris Butson:
>>>>>> I've had intermittent problems starting SCIRun in OSX. The behavior is 
>>>>>> as follows: I double click the SCIRun application in a Finder window. 
>>>>>> It starts X11 (if it's not already running), then the SCIRun icon 
>>>>>> momentarily appears in the Dock, and then it disappears. SCIRun never 
>>>>>> starts. Sometimes I am able to work around this by opening new X11 
>>>>>> terminal windows or closing existing windows. Sometimes I have to 
>>>>>> reboot the computer before SCIRun will start again. Has anyone else 
>>>>>> experienced this? Is there a workaround?
>>>>>> 
>>>>>> Details:
>>>>>> SCIRun 4.4 (though this behavior is reproducible with any version 4.x)
>>>>>> MacBook Pro running OSX 10.6.8
>>>>>> 
>>>>>> Thanks,
>>>>>> Chris
>>>>>> 
>>>>> 
>>>>> Any insights on that issue? I used to have it too with former versions 
>>>>> of SCIRun (also OS X 10.6.8.), but now with SCIRun 4.7. at least SCIRun 
>>>>> always starts. However, when I click on certain buttons, it crashes. 
>>>>> The output below is what it get, when I try to load a mesh by "file" 
>>>>> --> "load". But it also crashes with the  "UI" buttons of the modules. 
>>>>> So it seem's there are still unresolved issues with X11?
>>>>> 
>>>>> Best, Felix
>>>>> 
>>>>> 
>>>>> SHELL=/bin/bash
>>>>> SCIRUN_SRCDIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/src
>>>>> TMPDIR=/var/folders/Op/Op97LriYGB4oTB-m8VBWC++++TI/-Tmp-/
>>>>> Apple_PubSub_Socket_Render=/tmp/launch-JEtemb/Render
>>>>> WINDOWID=6291469
>>>>> XTERM_SHELL=/bin/bash
>>>>> USER=felix_lucka
>>>>> COMMAND_MODE=legacy
>>>>> TCL_LIBRARY=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/lib/tcl
>>>>> SSH_AUTH_SOCK=/tmp/launch-J3eAe4/Listeners
>>>>> __CF_USER_TEXT_ENCODING=0x1F5:0:3
>>>>> SCIRUN_ITCL_WIDGETS=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/lib/iwidgets/scripts
>>>>> PATH=/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin
>>>>> _=/usr/bin/env
>>>>> DBUS_FINK_SESSION_BUS_SOCKET=/tmp/launch-t8N5NQ/unix_domain_listener
>>>>> PWD=/
>>>>> SCIRUN_OBJDIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources
>>>>> XTERM_LOCALE=C
>>>>> XTERM_VERSION=XTerm(251)
>>>>> HOME=/Users/felix_lucka
>>>>> SHLVL=2
>>>>> LOGNAME=felix_lucka
>>>>> SCIRUN_THIRDPARTY_DIR=/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources
>>>>> DISPLAY=/tmp/launch-bxu02C/org.x:0
>>>>> SCIRun version 4.7 revision 45572
>>>>> adding matlabengine
>>>>> adding matlabenginefiletransfer
>>>>> create network editor
>>>>> open sciruntcl
>>>>> Load Tcl 8.6
>>>>> Load Tk 8.6
>>>>> Load itcl 4.0
>>>>> Load itk 4.0
>>>>> Load Iwidgets 4.0.1
>>>>> Load BLT 2.4
>>>>> Done configuring TCL
>>>>> start network editor
>>>>> copy and parse .scirunrc
>>>>> scirun> X Error: BadValue (integer parameter out of range for operation)
>>>>> 
>>>>> Thread "main" (id: 0x7fff71083cc0, pid: 658)
>>>>>        caught signal SIGABRT (Abort)
>>>>>        ...handle_abort_signals...
>>>>> niceAbort
>>>>> 0x7fff71083cc0:main( RUNNING, List: )
>>>>> 0x104006000:internal service manager(detached,  RUNNING, List: )
>>>>> 0x104049000:Event Manager Thread(detached,  BLOCKING, EventManager, 
>>>>> List: )
>>>>> 0x10408c000:Scheduler(daemon, detached,  BLOCKING, NetworkEditor 
>>>>> request FIFO, List: )
>>>>> 0x10418f000:TCL main event loop(detached,  RUNNING, List: )
>>>>> 
>>>>> Abort signalled by pid: 658
>>>>> Occured for thread: "main"
>>>>> Exiting
>>>>> bash: line 1:   658 Abort trap 
>>>>> "/Applications/SCIRun/SCIRun.app/Contents/Resources/bin/scirun"
>>>>> 
>>>>> 
>>>>> 
>>>>> --
>>>>> Dipl.-Math. Felix Lucka
>>>>> e-mail: felix.lucka@uni-muenster.de
>>>>> 
>>>>> Workgroup Imaging, Prof. Dr. Martin Burger
>>>>> Institute for Computational and Applied Mathematics, University of 
>>>>> Muenster
>>>>> www: http://wwwmath.uni-muenster.de/num/burger/organization/lucka
>>>>> 
>>>>> Workgroup Methods in Bioelectromagnetism, PD. Dr. Carsten Wolters 
>>>>> Institute for Biomagnetism and Biosignalanalysis, University of Muenster
>>>>> www: http://campus.uni-muenster.de/index.php?id=919&L=1
>>>> 
>>> 
>>> --
>>> Dipl.-Math. Felix Lucka
>>> e-mail: felix.lucka@uni-muenster.de
>>> 
>>> Workgroup Imaging, Prof. Dr. Martin Burger
>>> Institute for Computational and Applied Mathematics, University of 
>>> Muenster
>>> www: http://wwwmath.uni-muenster.de/num/burger/organization/lucka
>>> 
>>> Workgroup Methods in Bioelectromagnetism, PD. Dr. Carsten Wolters   
>>> Institute for Biomagnetism and Biosignalanalysis, University of Muenster
>>> www: http://campus.uni-muenster.de/index.php?id=919&L=1
>> 
> 
> -- 
> Dipl.-Math. Felix Lucka
> e-mail: felix.lucka@uni-muenster.de
> 
> Workgroup Imaging, Prof. Dr. Martin Burger
> Institute for Computational and Applied Mathematics, University of Muenster
> www: http://wwwmath.uni-muenster.de/num/burger/organization/lucka
> 
> Workgroup Methods in Bioelectromagnetism, PD. Dr. Carsten Wolters     
> Institute for Biomagnetism and Biosignalanalysis, University of Muenster
> www: http://campus.uni-muenster.de/index.php?id=919&L=1


Archive powered by MHonArc 2.6.16.

Top of page