Text archives Help

---

Title: RE: [SCIRUN-USERS]

Hello
        First, is there a web archive of this mailing list?  I couldn't find it on the main site.  Hate to ask a question that has already been addressed.
        That said, I am not able to build SCIRun on dual Quad-core EM64T architecture machine (8 cores).  I run debian (amd64 build) on this, and assumed with all the Ubuntu fanfare that this would be easy.  I got SCIRun compiled and running on a 32 bit single core debian machine, so I think it's possible. 
         I am attempting to build SCIRun.3.0.2 from the tar file.  After expanding and changing into the SCIRun directory, I run

./build.sh -j8

And things are fine.  Previous make attempts failed because of "undefined reference to gzopen64" error at about 34% completion, so after the build command I symlink all the libz files in the thirdparty.bin directory to this:

(in SCIRun/thirdparty.bin/3.0.2/Linux/gcc-4.2.3-64bit/lib)
lrwxrwxrwx 1 byrdi01 byrdi01 15 2008-04-15 08:21 libz.a -> /usr/lib/libz.a
lrwxrwxrwx 1 byrdi01 byrdi01 24 2008-04-15 08:23 libz.so -> /usr/lib/libz.so.1.2.3.3
lrwxrwxrwx 1 byrdi01 byrdi01 24 2008-04-15 08:23 libz.so.1 -> /usr/lib/libz.so.1.2.3.3
lrwxrwxrwx 1 byrdi01 byrdi01 24 2008-04-15 08:21 libz.so.1.2.3 -> /usr/lib/libz.so.1.2.3.3

Then run make.  The gzopen64 error seems to be resolved, but now it fails at 66% completion with the following output:

In file included from /home/byrdi01/SCIRun/src/Dataflow/Modules/Fields/ConvertTet.cc:33:
/home/byrdi01/SCIRun/src/Dataflow/Modules/Fields/ConvertTet.h: In member function ‘virtual SCIRun::FieldHandle SCIRun::ConvertTet<Fld>::convert_quadratic(SCIRun::FieldHandle)’:
/home/byrdi01/SCIRun/src/Dataflow/Modules/Fields/ConvertTet.h:94: error: no matching function for call to ‘SCIRun::TetVolMesh<SCIRun::TetQuadraticLgn<SCIRun::Point> >::TetVolMesh(SCIRun::TetVolMesh<SCIRun::TetLinearLgn<SCIRun::Point> >*&)’
/home/byrdi01/SCIRun/src/Core/Datatypes/TetVolMesh.h:927: note: candidates are: SCIRun::TetVolMesh<Basis>::TetVolMesh(const SCIRun::TetVolMesh<Basis>&) [with Basis = SCIRun::TetQuadraticLgn<SCIRun::Point>]
/home/byrdi01/SCIRun/src/Core/Datatypes/TetVolMesh.h:912: note:                 SCIRun::TetVolMesh<Basis>::TetVolMesh() [with Basis = SCIRun::TetQuadraticLgn<SCIRun::Point>]
/home/byrdi01/SCIRun/src/Dataflow/Modules/Fields/ConvertTet.cc: In static member function ‘static SCIRun::CompileInfoHandle SCIRun::ConvertTetBase::get_compile_info(const SCIRun::TypeDescription*)’:
/home/byrdi01/SCIRun/src/Core/Datatypes/PropertyManager.h: In member function ‘void SCIRun::PropertyManager::set_property(const std::string&, const T&, bool) [with T = std::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >]’:
/home/byrdi01/SCIRun/src/Core/Datatypes/PropertyManager.h:237:   instantiated from here
/home/byrdi01/SCIRun/src/Core/Datatypes/PropertyManager.h: In member function ‘SCIRun::PropertyBase* SCIRun::Property<T>::clone() const [with T = std::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >]’:
/home/byrdi01/SCIRun/src/Dataflow/Modules/Fields/ConvertTet.cc:60:   instantiated from here
make[2]: *** [Dataflow/Modules/Fields/CMakeFiles/Dataflow_Modules_Fields.dir/ConvertTet.o] Error 1
make[1]: *** [Dataflow/Modules/Fields/CMakeFiles/Dataflow_Modules_Fields.dir/all] Error 2
make: *** [all] Error 2

And from here I have no idea how to proceed.  An interesting note that there is a scirun executable in the SCIRun/bin directory, but is loads with a million warnings, which I have attached in ASCII. When I try to load a data file, that I know works on the other machine, it crashes with:

ERROR: Instantiating from nonexistant category SCIRun.MiscField
Error: can't create instance SCIRun_MiscField_ReportFieldInfo_0

Any ideas would be greatly appreciated.




Israel A. Byrd, PhD
Senior Scientist
SJM - AF Division/Minnetonka
Phone: (952) 351 1900
Fax: (952) 351 1250

SCIRun v3.0.2
Messages:
--------------------------

Loading packages, please wait...
Loading package 'SCIRun'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ApplyMappingMatrix' :
 - can't find symbol 'make_ApplyMappingMatrix'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateDistanceToField' :
 - can't find symbol 'make_CalculateDistanceToField'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateDistanceToFieldBoundary' :
 - can't find symbol 'make_CalculateDistanceToFieldBoundary'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateFieldData' :
 - can't find symbol 'make_CalculateFieldData'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateFieldData2' :
 - can't find symbol 'make_CalculateFieldData2'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateFieldData3' :
 - can't find symbol 'make_CalculateFieldData3'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateFieldDataCompiled' :
 - can't find symbol 'make_CalculateFieldDataCompiled'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateFieldDataCompiled2' :
 - can't find symbol 'make_CalculateFieldDataCompiled2'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateFieldDataCompiled3' :
 - can't find symbol 'make_CalculateFieldDataCompiled3'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateGradients' :
 - can't find symbol 'make_CalculateGradients'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateInsideWhichField' :
 - can't find symbol 'make_CalculateInsideWhichField'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateIsInsideField' :
 - can't find symbol 'make_CalculateIsInsideField'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateLatVolGradientsAtNodes' :
 - can't find symbol 'make_CalculateLatVolGradientsAtNodes'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateNodeNormals' :
 - can't find symbol 'make_CalculateNodeNormals'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateSignedDistanceToField' :
 - can't find symbol 'make_CalculateSignedDistanceToField'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateVectorMagnitudes' :
 - can't find symbol 'make_CalculateVectorMagnitudes'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertFieldBasis' :
 - can't find symbol 'make_ConvertFieldBasis'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertFieldDataType' :
 - can't find symbol 'make_ConvertFieldDataType'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertIndicesToFieldData' :
 - can't find symbol 'make_ConvertIndicesToFieldData'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertLatVolDataFromElemToNode' :
 - can't find symbol 'make_ConvertLatVolDataFromElemToNode'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertLatVolDataFromNodeToElem' :
 - can't find symbol 'make_ConvertLatVolDataFromNodeToElem'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CreateFieldData' :
 - can't find symbol 'make_CreateFieldData'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'GetFieldData' :
 - can't find symbol 'make_GetFieldData'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'MapFieldDataFromElemToNode' :
 - can't find symbol 'make_MapFieldDataFromElemToNode'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'MapFieldDataFromNodeToElem' :
 - can't find symbol 'make_MapFieldDataFromNodeToElem'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'MapFieldDataFromSourceToDestination' :
 - can't find symbol 'make_MapFieldDataFromSourceToDestination'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'MaskLatVol' :
 - can't find symbol 'make_MaskLatVol'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'MaskLatVolWithTriSurf' :
 - can't find symbol 'make_MaskLatVolWithTriSurf'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SelectAndSetFieldData' :
 - can't find symbol 'make_SelectAndSetFieldData'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SelectAndSetFieldData3' :
 - can't find symbol 'make_SelectAndSetFieldData3'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SetFieldData' :
 - can't find symbol 'make_SetFieldData'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeFieldData' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SwapFieldDataWithMatrixEntries' :
 - can't find symbol 'make_SwapFieldDataWithMatrixEntries'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateMeshNodes' :
 - can't find symbol 'make_CalculateMeshNodes'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertHexVolToTetVol' :
 - can't find symbol 'make_ConvertHexVolToTetVol'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertMLVtoHV' :
 - can't find symbol 'make_ConvertMLVtoHV'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertMeshCoordinateSystem' :
 - can't find symbol 'make_ConvertMeshCoordinateSystem'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertMeshToPointCloud' :
 - can't find symbol 'make_ConvertMeshToPointCloud'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertMeshToUnstructuredMesh' :
 - can't find symbol 'make_ConvertMeshToUnstructuredMesh'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertQuadSurfToTriSurf' :
 - can't find symbol 'make_ConvertQuadSurfToTriSurf'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertRasterMeshToStructuredMesh' :
 - can't find symbol 'make_ConvertRasterMeshToStructuredMesh'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertTVtoMLV' :
 - can't find symbol 'make_ConvertTVtoMLV'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'EditMeshBoundingBox' :
 - can't find symbol 'make_EditMeshBoundingBox'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'MapFieldDataToNodeCoordinate' :
 - can't find symbol 'make_MapFieldDataToNodeCoordinate'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SwapNodeLocationsWithMatrixEntries' :
 - can't find symbol 'make_SwapNodeLocationsWithMatrixEntries'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'TransformMeshWithFunction' :
 - can't find symbol 'make_TransformMeshWithFunction'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'TransformMeshWithTransform' :
 - can't find symbol 'make_TransformMeshWithTransform'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'ChangeMesh' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'TransformPlanarMesh' :
 - can't find symbol 'make_TransformPlanarMesh'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'BuildMappingMatrix' :
 - can't find symbol 'make_BuildMappingMatrix'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'BuildMatrixOfSurfaceNormals' :
 - can't find symbol 'make_BuildMatrixOfSurfaceNormals'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'BuildPointCloudToLatVolMappingMatrix' :
 - can't find symbol 'make_BuildPointCloudToLatVolMappingMatrix'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ChooseField' :
 - can't find symbol 'make_ChooseField'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CoregisterPointClouds' :
 - can't find symbol 'make_CoregisterPointClouds'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ReportFieldGeometryMeasures' :
 - can't find symbol 'make_ReportFieldGeometryMeasures'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ReportFieldInfo' :
 - can't find symbol 'make_ReportFieldInfo'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ReportScalarFieldStats' :
 - can't find symbol 'make_ReportScalarFieldStats'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ReportSearchGridInfo' :
 - can't find symbol 'make_ReportSearchGridInfo'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SelectFieldROIWithBoxWidget' :
 - can't find symbol 'make_SelectFieldROIWithBoxWidget'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SetFieldOrMeshStringProperty' :
 - can't find symbol 'make_SetFieldOrMeshStringProperty'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'MiscField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SetFieldProperty' :
 - can't find symbol 'make_SetFieldProperty'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ClipFieldByFunction' :
 - can't find symbol 'make_ClipFieldByFunction'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ClipFieldToFieldOrWidget' :
 - can't find symbol 'make_ClipFieldToFieldOrWidget'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ClipLatVolByIndicesOrWidget' :
 - can't find symbol 'make_ClipLatVolByIndicesOrWidget'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ClipVolumeByIsovalue' :
 - can't find symbol 'make_ClipVolumeByIsovalue'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CollectFields' :
 - can't find symbol 'make_CollectFields'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ConvertMatricesToMesh' :
 - can't find symbol 'make_ConvertMatricesToMesh'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CreateImage' :
 - can't find symbol 'make_CreateImage'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CreateLatVol' :
 - can't find symbol 'make_CreateLatVol'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CreateStructHex' :
 - can't find symbol 'make_CreateStructHex'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'ExtractPlanarSliceFromField' :
 - can't find symbol 'make_ExtractPlanarSliceFromField'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'GeneratePointSamplesFromField' :
 - can't find symbol 'make_GeneratePointSamplesFromField'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'GeneratePointSamplesFromFieldOrWidget' :
 - can't find symbol 'make_GeneratePointSamplesFromFieldOrWidget'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'GenerateSinglePointProbeFromField' :
 - can't find symbol 'make_GenerateSinglePointProbeFromField'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'GetCentroidsFromMesh' :
 - can't find symbol 'make_GetCentroidsFromMesh'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'GetDomainBoundary' :
 - can't find symbol 'make_GetDomainBoundary'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'GetFieldBoundary' :
 - can't find symbol 'make_GetFieldBoundary'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'GetSliceFromStructuredFieldByIndices' :
 - can't find symbol 'make_GetSliceFromStructuredFieldByIndices'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'InsertHexVolSheetAlongSurface' :
 - can't find symbol 'make_InsertHexVolSheetAlongSurface'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'InterfaceWithCubit' :
 - can't find symbol 'make_InterfaceWithCubit'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'JoinFields' :
 - can't find symbol 'make_JoinFields'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'MergeFields' :
 - can't find symbol 'make_MergeFields'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'MergeTriSurfs' :
 - can't find symbol 'make_MergeTriSurfs'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'RefineMeshByIsovalue' :
 - can't find symbol 'make_RefineMeshByIsovalue'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'RemoveHexVolSheet' :
 - can't find symbol 'make_RemoveHexVolSheet'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SplitAndJoinFieldByDomain' :
 - can't find symbol 'make_SplitAndJoinFieldByDomain'
Unable to load all of package 'SCIRun' (category 'NewField' failed) :
 - /home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libDataflow_Modules_Fields.so: cannot open 
shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'SubsampleStructuredFieldByIndices' :
 - can't find symbol 'make_SubsampleStructuredFieldByIndices'
Loading package 'BioPSE'
Unable to load all of package 'BioPSE' (category 'LeadField' failed) :
 - 
/home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libPackages_BioPSE_Dataflow_Modules_LeadField.so:
 cannot open shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'BuildElemLeadField' :
 - can't find symbol 'make_BuildElemLeadField'
Unable to load all of package 'BioPSE' (category 'LeadField' failed) :
 - 
/home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libPackages_BioPSE_Dataflow_Modules_LeadField.so:
 cannot open shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'BuildLeadFieldSourcesFromElectricCurrentMatrix' :
 - can't find symbol 'make_BuildLeadFieldSourcesFromElectricCurrentMatrix'
Unable to load all of package 'BioPSE' (category 'LeadField' failed) :
 - 
/home/byrdi01/SCIRun/bin/lib/libPackages_BioPSE_Dataflow_Modules_LeadField.so:
 cannot open shared object file: No such file or directory

Unable to load module 'CalculateMisfitField' :
 - can't find symbol 'make_CalculateMisfitField'
Loading package 'Teem'
Loading package 'MatlabInterface'

Finished loading packages.

---

• [SCIRUN-USERS], Wang, Kevin, 04/11/2008
  • RE: [SCIRUN-USERS], Jolley, Matthew, 04/11/2008
  • Re: [SCIRUN-USERS], Martin Cole, 04/11/2008
    • [SCIRUN-USERS] Dipole Position, Eduardo Morales, 04/11/2008
      • Re: [SCIRUN-USERS] Dipole Position, David Weinstein, 04/12/2008
    • [SCIRUN-USERS] Dipole Position, Eduardo Morales, 04/13/2008
  • RE: [SCIRUN-USERS], Jolley, Matthew, 04/11/2008
    • RE: [SCIRUN-USERS], Byrd, Israel, 04/15/2008

---

Archive powered by MHonArc 2.6.16.